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问题 绘制火山图时出错

分析的文件样本数很少(个位数)。样本数多的文件,分析会报错。所以这个应该怎么改呢(我前一段时间做都会报错,难道是数据需要更新?)

问题 转录组怎么和BSA结果联系起来?

转录组结果和BSA结果是否可以互相联合起来分析,怎么分析

问题 同物种构建进化树

同物种做同一个基因同源基因的进化树的时候,是所有基因一起进行进化分析,还是每一个物种单独分析之后再把图汇总到一起?如果一起做的话,同物种之间的基因会交叉出现在进化树上,这样可以吗?

文章 R| set.seed()作用使随机结果具有复现性

...,rnorm()函数为随机生成多个随机数,每次使用都会得到同的结果 > rnorm(3) [1] -2.0235077 0.3552526 0.6239982 > rnorm(3) [1] 1.101044 -1.297740 1.717356 如果我们想要让结果复现的话,就需要设定生成随机数的种子 > set.seed(1)    #...

文章 blast批量注释输出结果指定需要的列信息

... query.fa -db Ath_pep.fas  -max_hsps 1  \  -num_alignments 1 -evalue 1e-5 -num_threads 2   \  -outfmt "6 qseqid sseqid qlen slen pident length  mismatch gapopen qstart qend sstart send evalue bitscore qcovs stitle"\  -out tf.blast.out

问题 尊敬的老师!!恳请您在百忙中帮忙解答!根据群体遗传进化课程我构建进化树,显示如下错误。我的VCF文件通过如下命令进行排序,。排序后VCF文件缩小了很多,是对的吗?是是我的vcf文件有问题,但是我PCA和STRUCTURE都是可以分析的,急需亲爱的老师们解答!!!

run_pipeline.pl -Xmx30G  -SortGenotypeFilePlugin -inputFile clean.vcf.gz \    -outputFile clean.sorted.vcf.gz -fileType VCF

文章 史上首次!这篇论文你也能看懂:顶级期刊《柳叶刀》惊现全中文论文!

...102, 《柳叶刀》创刊于1823,有近200年的历史,有多牛就必再说了吧, 一直以来,我们心中理所当然的认为SCI论文嘛,那必须得是全英文的对吧, 但是就在昨天,11月26日, 它破天荒地发表了史上第一篇中文论文!! ...

问题 大家好!我想问下Fst&pi进行选择性消除分析后,得到的fst-pi.A-vs-B.selected.region.txt文件里的信息是A群体受选择的窗口还是A和B总的受选择的窗口?我怎么可以得到A或者B群体受选择的窗口啊

文章 植物单细胞分析方法

Cell calling To identify high-quality nuclei (a term used interchangeably with “barcodes”) using the filtered set of alignments, we implemented heuristic cutoffs for genomic context and sequencing depth indicative of high-quality nuclei. Specifically, we fit a smoothed spline to the log10...

文章 基于WSL2的docker更改存储位置

基于WSL2的docker同于之前基于Hyper-V的方式,之前我们可以在docker desktop中直接修改镜像的存放位置。现在使用基于WSL2的docker软件没有给出调整镜像存放位置的功能,需要我们手动的来调整。以下是具体操作的步骤。 Docker下...

问题 circos图配置文件整理

教程上的是拟南芥的分析,我现在是分析的水稻,有12条染色体,运请问在conf2.txt文件里该这么修改?rule这里染色体之间该这么修改?谢谢!  

问题 共线性

老师您好,有一个问题请你帮忙看看。为啥同样一组数据共线性的对数一样?文件都是一样的。

问题 mcscan运行出错

请问为什么block和bed文件对应上呢

问题 亚细胞定位

蛋白质做亚细胞定位预测,用同的网站预测结果一样,该怎样确定呢

问题 LDdecay

老师您好!做出来的LDdecay图是这个样子的,知道应该怎么去解释。请老师指点怎么是哪里报错了,应该怎么解释这个图。