找到约 15 条结果

问题 下面R语言while循环中为甚输出的是最后一个值?

...+1 +   } > x  [1]      1      1      2      3      5      8     13     21     34     55     89    144    233    377    610 [16]    987   1597   2584   4181   6765  10946  17711  28657  46368  75025 121393 196418 317811 514229 832040 ...

问题 关于annover建库问题

...SequenceDictionary -R pearref.fa -O pearref.dict ********** 07:49:38.581 INFO  NativeLibraryLoader - Loading libgkl_compression.so from jar:file:/biosoft/miniconda/envs/reseq/share/picard-2.22.1-0/picard.jar!/com/intel/gkl/native/libgkl_com                         pression.so [S...

问题 老师您好,我在做宏基因组学分析时,由于样本数据量过大,将所有样本质控后的reads用进行组装时,会出现服务器内存足无法组装的情况。那我想将每个样本的数据分别组装,然后将样本contig文件进行合并后再进行下游分析。这种方法可行吗?

文章 windows 中的docker如何设置容器的内存与计算资源 WSL

...-V的, 由于新的docker可以基于WSL的,设置docker的资源有所同: 如果是基于hyper-v的设置资源可以参考这里:https://www.omicsclass.com/article/1413 如果是基因WSL的docker,设置会提示:我们就访问 https://docs.microsoft.com/en-us/windows/wsl/wsl-c...

文章 双11优惠火热进行中---生信课程历年最大优惠来袭!

...止到今天,共计发布60+门生物信息视教程,涵盖基因组分析、群体研究、转录调控、癌症数据库挖掘、微生物研究、生信基础(Linux、Python、R、Perl)等方向,学员数量已超过70000人!多门课程被推送到网易云课堂首页推荐位,...

问题 老师,我要做泛基因家族分析中泛基因列表构建,我是是只需要把data数据的基因组和gff文件链接过去,用再建文件夹下了,然后一步步做Rstudio的操作么,我需要下pangenlist里面的哪些文件到自己的服务器?

是除了demo里的文件,其他的都要下,或者替换为自己的品种,我看有的数据可能是加环境。

文章 组装"预实验" | 物种倍性分析

...域。因此我们在进行基因组评估之前,需要先做一下倍性分析。 倍性分析有哪些方法? 1.实验方法 压片法: 通过促进细胞有丝分裂,使用秋水仙素使细胞分裂停止在有丝分裂中期,然后固定、酶解、染色、烘烤等方法将...

问题 我买了转录组分析的课程,在运行fpkm_and_plot.R脚本时提示Error in library("getopt") : there is no package called ‘getopt’ Execution halted, 我打开R语言安装getopt后仍然显示报错,请教各位大神和组学讲堂的老师

问题 染色体注释的圈图,共线性分析,怎样设置同染色体共线部分的颜色,例如把chr1和chr2共线部分设置成红色,chr2和chr3共线部分设置为绿色,chr3和chr4共线部分设置成紫色,应该怎么改配置文件呢?

问题 请问利用jcvi整理泛基因列表,做JCVI做共线性分析时,一直提示/bin/bash: lastdb: command not found,是没有安装Last软件包吗?目前使用的镜像是购买课程时老师提供的,数据是26个玉米基因组数据(由于空间足,只用了19个基因组)

文章 ppi_network.r 蛋白互作网络分析

使用说明: $ Rscript $scriptdir/ppi_network.r -husage: /work/my_stad_immu/scripts/ppi_network.r [-h] -g gene.list [-s ann.db]                                                [-t score_threshold]                                                [-v...

文章 从GTF中提取lncRNA的编号和名称

...据挖掘感兴趣,请学习我们的TCGA相关课程: 《TCGA-生存分析》 《TCGA-基因差异表达分析》 《WGCNA加权基因共表达网络分析》 《GEO芯片数据挖掘》 《GSEA富集分析

问题 老师您好,我在用MEGA构建完系统进化树后,树的下方有一大片空白,选中某一分支的绿色选中框也偏下,在分支本身,卸了又重装,重新分析建树依旧是这种情况,想请教一下老师有没有遇到过这种情况,谢谢!

老师您好,非常感谢您回答我的问题! 以下边是我截出的图片: 1.首先新建的树下方有很大空白; 2.我想要选中图中红色圈标记的分支,但是选中; 3.在下方空白部分盲找,才能点出上图中的分支绿色选中框,也能对其...

文章 BSA分析中QTL-seq 分析:95% 99%阈值置信区间是如何计算的

这里R语言源代码,有兴趣的可以研究看看 ####################################Arg<-commandArgs(TRUE)###########input###############################################individual_analysis<- c(Arg[1])reprication<-c(Arg[2])filter_value<-c(Arg[3])population_structure<-c(Arg[4])...

文章 U盘安装 CentOS 注意问题

...,具体信息如下:[OK] Reached target Basic System 到这里就卡住动了。第一反应就是 grub 找到启动盘符。通用解决方案网络上很多文章对于这种解决方案都是通过,找到 U盘的盘符,然后直接修改 grub 启动盘符的形式来安装系统。...