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问题 那老师有什么办法解决因为内存无法运行docker这个问题吗?

文章 如何将SNP标记转化成可跑胶验证的CAPS标记

...且对DNA的浓度要求不严格;使用的引物较长,扩增的结果比较稳定且避免了RFLP分析中的膜转印这一步骤,又能保持RFLP分析的精确度。另外,由于很多限制性内切酶均可与扩增DNA酶切,所以检测到多态性机会较大。操作简便、快...

文章 快速高效KM生存曲线绘制-脚本使用

...浸润组的生存率更高。同时图中还添加了基于Log-rank检验比较两组生存曲线得到的P值,通过P值可以判断两组生存曲线之间是否有统计学差异,一般认为P值于0.05即表示两组间有显著的生存差异。 为了使大家更简便快捷地绘...

问题 具体用那些数据分析 是两两比较还是总的比较

你好 老师 我做了5个时期的种子的转录组,其中有两两比较,具体怎么分析,请老师知道一下

文章 perl 中批量创建不同的文件,用于文件批量分隔成文件

#分享一段代码 use FileHandle;use PerlIO::gzip;if ($ARGV[4]=~/gz$/){open IN, "<:gzip", "$ARGV[0]" or die "$!  actions";}else{open IN, "$ARGV[0]" or die "$!";} #批量创建文件,把创建的文件句柄放到,hash中存储; my%fout=();for my$i (1..10){my $f=FileHandle->new("&g...

文章 研究miRNA必备的分析网站汇总!

...酸的RNA分子,可通过多种途径调控基因的表达。目前研究比较清楚的3条调控途径分别是:DNA甲基化,RNA剪切和翻译阻止。在调控基因表达、细胞周期、生物体发育时序,疾病等方面都起到重要作用。 miRBase miRBase数据库是一个...

问题 如果interproscan数据库只指定部分,对注释结果影响大吗?

请教老师,-appl CDD,COILS,Gene3D,Pfam,SMART(运行ok,约4时),是否还需要增加哪些必须的数据库?谢谢

文章 corrplot包绘制相关性图,简单又好看!

... tl.col = "black", addCoef.col = "black", # 添加相关系数 number.cex = 0.7) # 数字字体大 结果如下图: 图形类型默认为圆形,将其改为矩形的: corrplot(corr_matrix,method = 'square', type = "upper", order = "AO...

文章 muscle新版,旧版使用的一些差别

...马尔可夫模型(HMM)的参数,muscle利用的ppp算法是随机量调整其隐马尔可夫模型(HMM)的参数。这些调整称为扰动。 HMM 参数是 0 到 1 范围内的概率。按照惯例,SEED=0表示没有引入扰动,因此 使用默认的 HMM 概率。 5.其他参数...

文章 Mapchart绘制基因染色体位置图

...染色体位置图都不方便。在这里,编给 大家介绍一个比较早的软件Mapchart,来帮助我们解决这一烦恼。 Mapchart是Windows系统下,进行基因在染色体上定位图片绘制的工具,主要是针对遗传连锁图和QTL。区别于遗传图谱中遗传距...

问题 用enrichGSEA和用官方GSEA软件跑出的多条通路都是相反的,是为什么呢

...文件,提供组别信息,如果我不把四组列出来,只列我想比较的两组,跑出来的结果也会有好多条我认为标志性的通路时反的。

文章 细胞转染效率低怎么破?攻略在这里......

...中,大部分的工作是利用基因功能研究来探索生命过程,如何将目的基因导入细胞内是科学实验过程中不可缺少的实验技术,而细胞转染是完成这一过程的必需步骤。 在实验当中,我们经常遇到的一种情况就是转染完细胞,...

文章 基因组组装质量评估

...te(90%以上)以及coverage(95%以上)认为组装结果和reads有比较好的一致性。 2. 序列完整性评估 评估组装得到的基因组对基因区的覆盖程度。一般需要借助RNA方面的证据进行评估,如EST数据或RNA reads。由于用来评估的RNA方面证...

文章 CORNERSTONE,一款让你无法自拔的项目管理工具

...间间隔)所需要的工时、成本等信息,从而可以更合理地调整资源在任务上的分配。 新建任务: 为了方便各位成员,分配任务,现在再也不用操作那么多的繁琐步骤,点击需要分发任务的项目组成员任意空白位置,拖拽...

问题 ks计算物种共同祖先WGD事件的问题

同一个物种,物种内的ks比较它们的共同祖先基因组复制时间,物种A3是物种A1和物种A2的共同祖先,计算结果显示物种A1与物种A3的ks值为0.7,物种A2与物种A3的ks值为0.9,结果如何解读?感觉矛盾