问题 您好，请问用plantcare做启动子预测，有的基因上有顺式作用元件，为什么用GSDS作图却显示没有

问题 老师好，我启动bio-linux时先黑屏一下,然后显示异常退出并出现下面的代码，请问该如何解决？

问题 图1是用命令查询了，图2就是遇到的问题，文件始终显示无法启动传输，但有几个已经传输成功了

问题 老师您好，我做MCScanX 进行blast建库时总是报错，文件前加上绝对路径也还是报错显示文件不存在

文章 在线绘制基因染色体位置图

...和颜色，染色体的宽高以及颜色，基因名称的字体大小及显示方式等。大家可以试着设置一下，绘制自己需要的图片，小编这里就不细讲了。绘制好图片后即可下载需要的图片格式。 好了，今天就到这里，大家操作一下试试...

问题 重测序中两个GATK运行都失败，显示如下代码和图片，麻烦老师进行解答

Error: LinkageError occurred while loading main class org.broadinstitute.hellbender.Main         java.lang.UnsupportedClassVersionError: org/broadinstitute/hellbender/Main has been compiled by a more recent version of the Java Runtime (class file version 61.0), this version of the Java Runtime ...

问题 基因家族分析时，提取cds与pep序列报错显示 no sequence

Error, no sequence for Scaffold1 at /share/work/biosoft/TransDecoder/latest/util/gff3_file_to_proteins.pl line 84. 应该如何解决？代码与报错如下， 我的基因组gff文件是这样的，我看课程示例文件是ID=XX;Parent=xx,是因为这个才提取不出来吗

问题 补充细节： 运行WGCNA代码后，12_Network heatmap plot_all gene.pdf 这个文件总显示文件大小为0

...运行脚本后，12_Network heatmap plot_all gene.pdf 这个文件总是显示 文件大小为0，打开时显示“格式错误，文件已损坏”。请问这该怎么解决呢？非常感谢 老师，我刚重新运行后，看到错误提示是：Error in dev.off(): internal read in PDF_end...

问题 HMM搜素后显示No targets detected that satisfy reporting thresholds，生成的文件没有候选基因

检查过下载的HMM模型和蛋白序列都没有问题 生产的文件是这样的

问题 ka/ks利用课程脚本输出了一对完全一样的串联重复基因但mcsacnX做图时为啥没显示串联重复基因

问题 这里显示没有安装解释器，不能新建文件夹，这是怎么回事？就在官网下载的解释器呀，这是咋回事？

问题 成功启用镜像后，目录下的文件可以查看到，大小也是正确的，但是total显示为0，如何解决这个问题？

文章 Linux重定向以及nohup不输出的方法

... 1：表示标准输出(stdout)，默认情况下，它与终端设备（显示器）连接，程序可以通过标准输出将结果、消息或其他内容输出到终端上显示给用户。 2：标准错误信息输出(stderr)，默认情况下，它也与终端设备连接，用于输出错...

文章 进化树中bootstrap值设置

...在线软件在进化树修饰方面非常出色。在设置Bootstrap值的显示方式上也是非常的优秀。 设置方法 1.使用进化树“(A:0.1,(B:0.2,(C:0.3,(D:0.4,E:0.5)40:0.6)80:0.05)100:0.1)90:0.43;”进化树必须含有bootstrap值。 2.点击 “Basic > show/hide bootstr...

问题 测序数据质控报告GC分布

...据去blastNT数据库除了一些肠道共生菌之外，有百分之20多显示unknown。不太理解unknown的部分是什么呢？并且map结果统计文件中可以看见每条染色体的深度和覆盖度，但是除了物种本身的十几条染色体外，最后出现了5.8S核糖体RNA和...