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文章 生物专业由冷转热?你还敢选生物专业吗?

...是生物的世纪”。 在这个“预言”的感召下,很多人毫犹豫地选择了各大高校的生物专业, 当年大学的生物专业分数线硬是“高人一等”哦~ 而在以后的十几年里,生物专业招生由最开始的“火爆”,逐渐转为平静,现在...

问题 保留蛋白编码基因一直错误!!!

每一步都是根据视操作的,确认过无数次代码没有写错,就是知道什么原因,从gff文件中提取的蛋白编码基因的文件一直是0KB。请众位老师赐教!

文章 综合转录组学和代谢组学分析揭示了菜豆响应冷胁迫的关键调控网络

...置叶片在液氮中快速冷却并储存用于提取RNA 。 二、实验分析结果 探究低温胁迫对菜豆光合指数和MDA(丙二醛)含量的影响。                a. 测量了冷胁迫对照处理3天后093CK、093T、120CK和120T四组植株的净光合速率 (Pn)...

文章 单细胞转录组数据挖掘流程记录-UM葡萄膜黑色素瘤(GSE139829)

...cRNA-seq 以单细胞分辨率询问肿瘤微环境。肿瘤细胞的子集分析证实了从批量分析中建立的全局基因组图谱,并揭示了新描述的亚克隆基因组复杂性和与表型可塑性一致的转录状态。免疫区室包含以前未被识别的细胞类型多样性,...

问题 lncRNA测序,如何把四种RNA分离,或者只提取mRNA

老师,我的样本测的是lncRNA测序,但是下游只想分析mRNA,请问有没有什么软件可以把mRNA、lncRNA、circRNA分开,或者只把mRNA提取出来,用于后续分析

文章 当代博士的真实困境:秃头、延毕、论文难发、母胎单身......

...比工作轻松多了。。 事实上,读博与其说是学习,倒如说是在“练级”更恰当些——经历各种挫败,一步一步徒手打怪,一次一次粉身碎骨又重新组合,在崩溃中艰难挣扎,为了最后的那本学位证书。 当代博士的四大困...

问题 请问基因表达模式折线图怎么画

从聚类到画图,应该用什么软件或者R包呢?另外太明白输入的是表达量还是foldchange?

文章 多分组venn图绘制脚本

绘制多分组venn图时发现好多包都支持,只能用原始的包,脚本如下 #!/share/work/biosoft/R/latest/bin/Rscriptargs <- commandArgs(trailingOnly = TRUE)library(venn)library(VennDiagram)library(purrr)# 读取命令行参数input_file <- args[1]output_prefix <- args[2]#...

问题 转录组测序数据量如何选择?

我想做个转录组实验,但是知道应该测多少合适,公司说有有4G、6G、8G之类的是啥意思?怎么衡量测的数据量够够呢?

问题 kaks计算过程问题

您好,我们采用了aln2axt.pl脚本运行,但运行得到的axt文件仍然equal,我们检查了我们序列的长度,序列比对总长度是3的整倍数.序列都含有起始密码子ATG,请问一下如何解决呢?

文章 duplicate_gene_classifier统计全基因组同类型复制事件的数目

...ifier属于MCScanX的核心程序,用于基因分类,统计全基因组同类型复制事件的数目。 命令行格式: $duplicate_gene_classifier Dl Dl是物种缩写。在运行duplicate_gene_classifier程序时需要去掉文件后缀名。 准备原始文件1:Dl.blast文件;...

问题 SSR引物设计

...这个脚本做其他序列都是没问题的,只有做这个序列设计出引物,是序列太大了吗?

问题 宏基因组基因定量salmon

老师您好,我在用salmon构建索引之后,对每个样本进行定量时显示支持RapMap类型的索引,请问该怎么解决?详见图片

问题 R语言中$符号和@符号取值区别?

想得到Vennerable绘制韦恩图,每一个交叉位置对应的ID信息,知道怎么取得?

问题 Cytoscape图片导出的问题

请问老师,我在软件中美化好的图片跟导出的图片相同应如何解决,1是软件中美化好的图片,2是导出的PDF图片  想要导出后的图片连线为直线 并且没有无效文字的显示