绘制饼图的过程中，利用ggplot2的geom_bar结合coord_polar实现，需要理解的点是饼图的排布是按照aes(fill）的因子顺序确定的。譬如数据如下 > dat type Num1 A 902 B 343 C 564 D 995 E 15 必须根据...
....counts.tsv.gz done #合并人的所有的counts数据,awk只输出第一个文件的表头 zcat *.counts.tsv.gz |awk -F"\t" 'NR==1 || $1!~ /barcode/ {print $0}' |gzip - > all_human_counts.tsv.gz 单细胞分析 这个数据有点特殊为indrop的单细胞数据, 也是测的3’端，因...
# 对基因组构建HISAT indexecho "Step1: build reference index "hisat2_extract_splice_sites.py /bioData/run_data/lixp/work/GZ_yangtao2/refs/Yangtao2.coding.gene.V1.0.20190227.gtf > /bioData/run_data/lixp/work/GZ_yangtao2/refs/splicesites.tsvhisat2_extract_exons.py /bioData/run_data/lixp/work/G...
想咨询一下，想注释出来那些样本，使用附赠的课程里的3个月的服务器，能不能带的动？谢谢
...组，搜索我所研究的昆虫也几乎没有什么基因，但是同一个目 的昆虫有比较深入的研究了。这是前提。正在着手测基因组，但前期测了一个无参的转录组，从中挑选并得到一段序列，公司标注这是cds区的序列1、我可以利用这段...
... 1.安装软件下载地址主页：MCScanX MCScanX源码地址，把这个文件下载下来：http://chibba.pgml.uga.edu/mcscan2/MCScanX.zip 下面的代码，可在我们的biolinux系统上直接执行，创建目录及下载： cd /biosoftsudo wget http://chibba.pgml.uga.edu/mcscan2/MCScanX...
...因的鉴定 作者通过blast方法，在冬枣基因组中共鉴定到30个扩展蛋白家族基因，如下图：共划分为4个亚群：19个ZjEXPAs、 3个ZjEXPBs、1个ZjEXLA和 7个ZjEXLBs。 绘制家族内基因染色体位置分布图，如下图：其中一个ZjEXPA19位于scaffold上...
老师，请教您一个关于RNAseq数据分析的问题，如果我有1个对照组、3-5个实验组（每个实验组有两个重复），我可以对1-5组一起进行RNA-seq差异基因表达分析吗？可以用什么方法呢？ 我目前只接触过两组间（1个对照组、1个实验组...
...序列能相互的校正序列，提高准确率 如上图所示，一个文库是有两个哑铃状的测序接头和中间的待测序列构成。 1. Polymerase Read: 是一个测序聚合酶，在一个环装文库分子上，一直读取的序列，一般会很长，可能对环装分子读...
...另有健康玉米幼苗作为对照组，随机选取5株幼苗作为一个生物学重复。感染组和对照组各3个生物学重复，共6个样品； 2、针对RBSDV的S6区段设计引物，用于RBSDV拷贝数的测定； 3、TMT标记； 4、蛋白质进行GO和KEGG注释； 5、QRT-PC...