问题 各位老师好，我在做拟南芥紫色酸性磷酸酶基因家族分析，该家族中有29个相关基因，我通过pfam 数据库关键词搜索得到一个检索号，然后下载后通过hmmsearch 分析，但结果只有25个相关基因，请问是怎么回事？问题出在哪里？

问题 老师您好，我在转录组数据中筛选了一个转录因子（NAC），前期我对这个转录因子相关的6个基因做了克隆及表达分析，现在问题是怎样将这些基因的表达量和转录组数据的转录因子表达量联系起来？

在转录组数据中筛选了30个转录因子（NAC）的表达量，两个品种，3个时期； 前期做了6个基因的表达量，6个品种，5个时期； 现在怎样把基因和转录因子联系到一起，看文献都说做相关聚类热图，或者WGCNA,但相关聚类热图只能...

问题 老师，我在两个基因组间的共线性分析时，在excel中用到vlookup时，出现了跟您在课程里实操分析时数据筛选时，只出现了#N/A，不知道是什么原因

问题 蛋白序列ID和cds序列ID不一致

...10.41.gff3 mRNA2geneID.txt，提取到的ID=Zm00001d027240_T001，而在hmm搜索的结果ID=Zm00001d027240_P001，在去除重复的hmmer搜索的转录本ID时，ID不一致，同时hmm搜索的结果ID和cds序列里ID也不一致，无法提取cds序列

文章 细胞转染效率低怎么破？攻略在这里......

...动，切忌用力吹打，会导致脂质体失去作用。 稳转株的筛选 根据不同的实验需求，如需进行划痕、transwell等培养时间较长的实验，最好使用稳转细胞株，而如果只需检测相应蛋白的表达不用较长时间培养，选择瞬转即可。 质...

问题 老师您好，为什么在gwas最后的筛选关联区域SNP信息时，总报错错误信息如下，总是被杀掉，vcf文件应该是没有错的，截图如下，输入文件如下，请您帮忙查看，我该怎么修改我的命令

文章 grep --color=auto使用用法介绍

grep是一个常用的文本搜索工具，用于在文件中查找文本字符串。grep--color=auto是grep的一个扩展选项，主要功能是匹配的特定字符串加上颜色以区分，并可以进行高亮显示。可以方便我们快速查找相应的文本字符串并进行区分，提...

文章 欢迎加入组学大讲堂问答社区

...经积累了很多组学相关的问题及答案了，说不定，您进来搜索下问题关键词就找到答案了！还等什么，想问就大胆来问吧！ 2. 分享记录经验知识 小编10年生信生涯最大的收获是习惯了知识及经验的总结记录，例如：学习一款新...

文章 叶绿体基因做跨物种系统发育分析

...区分所属样品）进行比对，e-value =10−6 ，从比对结果中筛选在所有样品中都存在的叶绿体基因，并提取各样品中对应基因的蛋白质序列，不同基因的蛋白质序列存放在不同文件中。在这里，可以选择 2. 中从NCBI下载基因的物种...

问题 老师，在做基因的顺势作用原件的过程中，最后形成两个配置文件，视频里说，通过对下面文件划线处命令的编写可以筛选想要的顺势作用原件。但是老师，我现在想要展示所有的顺势作用原件，我应该怎样设置这个命令？

问题 motif

鉴定得到的motif和已知该基因家族的motif相似性较低，或者说含有更多未知的motif，已经扩大了motif的搜索结果，并且多次调整motif搜索范围，得到的已知该家族的motif数量还是较少。是什么原因呢？

文章 木薯KUP基因家族分析-基因组质量差也挡不住基因家族鉴定分析

...家族基因的HMM隐马尔科夫模型；基于这个模型再利用hmmer搜索木薯基因组当中所有的KUP基因蛋白序列，搜索到的KUP基因序列再提交到Pfam数据库和NCBI中的CDD数据库中进一步确认KUP结构域；最后作者在木薯基因组中鉴定到21个KUP家族...

文章 好的产品经理应具备哪些能力？

...须要具备良好的沟通协调能力、团队合作能力、任务合理分配能力、处理团队内外部的人员关系的能力。 其次，是项目管理能力，作为一个产品经理，必须要了解并参与过产品从诞生到优化的整个过程，否则连产品诞生的流...

文章 食管癌 10X多样本（GSE145370）

...53 IIIA T S134 GSM4317411 S135A Male 71 IIA T S135 GSM4317412 S149A Male 81 IIA T S149 GSM4317413 S150A Male 73 IIIB T S150 GSM4317414 S158A Male 55 IIB T S158 GSM4317415 S159A Male 54 IIIB T S159 GSM4317416 S133B Male 60 IIIB N S133 GSM4317417 S134B Female 53 IIIA N S134 GSM4317418 S135B Ma...

问题 重测序

...l 山羊SNP， 怎么设置比较合理？那在运行的时候就要减少分配的内存了，一个任务分给20G，同时运行5个任务可以把？不知道分给20G的内存够不够？ 这并行运行和直接分给100G 一个任务运行，速度有差别吗？ nohup ParaFly -c  w.sh -...