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文章 ggplot2中各种主题元素修改对应方法函数速查表

...改: 例如图片的title主题元素名称为plot.title,为文字。可以用element_text()方法修改显示样式: 字号调大一下: p1<-ggplot(mtcars, aes(wt, mpg)) + geom_point() + labs(title="Fuel economy declines as weight increases") p1p1 + theme(plot.title=element_text...

文章 Windows里MaxQuant下载与安装

...个小时,效率较低而且对笔记本硬件要求较高。有条件的可以去linux系统上使用MaxQuant进行搜库分析,     Linux系统中MaxQuan操作笔记:https://www.omicsclass.com/article/2245

问题 关于基因家族分析中可能有问题导致结构无法分析得的各文件截图

...的话,我关于每一步怎么做的脚步还有记录和保存,如果可以的话,我能否在QQ的组学大讲堂与您取得联系呢?非常感谢老师!!

文章 perl 中 $#ARGV 是什么意思

...@ARGV用在标量上下文中,而直接操作最后一个数组元素,可以利用负数索引值。如: $i = @ARGV; $n = $ARGV[-1];

文章 Linux下判断数值大小

... 此外,我们在网易云课堂上有各种教学视频,有兴趣可以了解一下: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?...

文章 Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 纠错软件-HECIL

...,比如我在运行bwa 过程中,就需要依赖“/lib64/libc.so.6” 这个,解决方案就是自己从新下载一个bwa ,进行安装 2. 软件的运行 软件是一个python 脚本,所以运行时需要有python 2.7。 usage: HECIL.py [-h] -l LR -s SR -len LENGTH_SR -o OUTPUT [-lc LO...

文章 停止、删除所有的docker容器和镜像

...er 1.13 中增加了 docker system prune的命令,针对container、image可以使用docker container prune、docker image prune命令。 docker image prune --force --all或者docker image prune -f -a` : 删除所有不使用的镜像 docker container prune -f: 删除所有停止的容器

文章 GSDS指定序列顺序

... 此外,我们在网易云课堂上有各种教学视频,有兴趣可以了解一下: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂...

问题 在RStudio上用setwd()命令未能修改数据资料路径

...》课,安老师在课程最后面说:在RStudio上用setwd()命令可以修改数据资料路径,我在D盘建立了新的空的文件夹20251124_data和20251124data,用setwd("D:/20251124_data")和setwd("D:/20251124data"),但是运行不成功,显示: >  setwd("D:/20251124_da...

问题 在进行KAKS计算时出现不报错,但结果文件是空的现象

...er@bl8vbox[dupl-id1] 这是计算完成有结果输出的显示! 自己比对了命令,没有看出来哪里错了!哪位老师能解答一下?先谢谢了!

文章 R语言统计相同ID出现的频率并用ggplot2绘制柱状图

...n)]=">=11"  ran=ran[-1]  ran} #统计频率,并把大于11的 归类一起: data=table(data)data[data>10]=11MassStatN <- with(hist(data, breaks=seq(0, 11, by = 1), plot=FALSE),                     data.frame(N=counts, Mass=pairjoin(breaks), PCT=counts/sum(counts...

问题 iqtree2 iqtree2 -s supergene.phy -st DNA -m TEST -B 1000 -bnni -alrt 1000 --prefix iqtree出现报错

使用run_pipeline.pl将vcf.gz文件转换为.phy文件后运行该命令,出现报错,报错内容如下图: phy文件检查了里面有AGCTKMNRSWY这11种字符,这个正常吗?是哪里出错了呢

问题 采用RSeQC 对bam 文件进行质控分析时,用inner_distance.py报错。

...istributionNotFound(req) pkg_resources.DistributionNotFound: pysam 网上搜索了报错信息,还是不明白,不知道怎么解决。

文章 OrthoFinder 输出结果文件说明

...species tree)。 通过参数 -M dendroblast 或 -M msa,OrthoFinder 可以调用 STAG 中两种构建物种树的方法:DendroBLAST(默认) 和 CMSA(Concatenated Multiple Sequence Alignment,联合多序列比对)。 使用 STRIDE(Species Tree Root Inference from Gene Duplication ...

问题 您好,我用cytoscape 的BinGO进行GO富集分析时,参照你们提供的无参 GO注释的demo, 怎么运行不了?请您指教

...GO) i0_HQ_W_c10162/f2p0/728 = 0015078 i0_HQ_W_c10176/f5p0/771 = 0006457 我这个格式有错吗? 谢谢, 照你们的demo描的,但是运行没有结果。请问何原因。能提供准确的demo格式吗?谢谢!!