问题 老师，这是我做出来的PAV热图，每个基因都是物种独有的，这个PAV热图效果是不是不好，这个PHY家族是否合适继续研究，没办法做聚类分析这些了

问题 基因家族第14课时，基因家族加倍与复制中分析的问题

#找到我们分析的基因家族的共线性分析关系（大片段复制现象）： cd /work/my_gene_family/MCScanX perl /biosoft/MCScanX/MCScanX/downstream_analyses/detect_collinearity_within_gene_families.pl -i crk_family.txt -d mcscan/os.collinearity -o crk.collinear.pairs 这一步分析...

文章 转录组数据挖掘的几个建议

最近有不少的小伙伴，向我咨询，如何挖掘转录组标准分析之后的结果，我总结几条建议供大家参考 1. 明确研究目的 研究目的一定要明确：为了解决什么问题，采用了什么样的实验方案设计。 2. 基因型和表型研究的目的是从...

文章 文献下载（更新-ing）

...u.com/ 谷歌学术：https://scholar.google.com/schhp?hl=en&as_sdt=0,5 文献小镇：http://www.sci-hub.ac.cn/index.html SCI-HUB： 以下均可以用https://sci-hub.tw https://sci-hub.se https://sci-hub.shop 镜像：http://www.hlhmf.com/ http://ac.scmor.com/ 有好的工具我会及...

文章 使用vcftools对vcf文件做滑窗处理

...体方法如下： vcftools --gzvcf raw.filtered.snp.vcf.gz --window-pi 125 --window-pi-step 5 --window-pi 指定窗口大小， --window-pi-step 指定步长大小 结果文件格式如下：

文章 Linux 设置MySQL开启自动启动

...d3. 添加服务chkconfig --add mysqld4. 显示服务列表chkconfig --list5. 看到3、4、5状态为开或者为 on 则表示成功。如果是 关或者 off 则执行一下chkconfig --level 345 mysqld on6. 重启电脑reboot

问题 老师，您好！我在网易云课程上学习《微生物16S/ITS/18S/分析原理讲解》课程，我想自己操作，我想跟您要原始数据、qiime命令和R绘图代码可以吗？

问题 在鉴定长链非编码RNA分析中，合并转录本之后，如何批量从gffcmp.combine.gtf文件中提取class_code为i, u,和x的转录本?谢谢

问题 向各位老师请教下关于遗传图谱的问题，我的实验群体为半同胞家系，需要进行遗传图谱绘制与QTL分析，请问下该如何绘制遗传图谱，用什么软件？向各位老师请教！万分感谢！

问题 老师好，做比较基因组学时候发现我的基因ID和转录本ID不是单纯的加了点1点2那么简单，如何做我才能只提取一个序列进行后续分析呢？

问题 老师，您好！请问在进行Linux生信分析环境搭建时，输入 sudo mount –t vboxsf windows-SHARE share后，显示no such device,是怎么回事？该怎么处理呢？

问题 结合转录组分析时，查找GEO号后没有EXCEL下载，只有一个压缩包，里面有三个TXT格式的数据，请问是物种的问题还是别的原因，如果没有问题，这三个txt该如何取舍，谢谢。

问题 老师您好，在分析IBD的时候出现Exception in thread "main" java.lang.IllegalArgumentException: missing genotype separator (.)，这样的报错，VCF已经过滤，设置的是0.8，这是怎么回事

问题 老师您好！我是组学大讲堂基因家族分析课程的学生，请问现在omicsclass的镜像是不能拉取了吗，里面的gene-family镜像是不是删除了，怎么找不到了。

问题 perl 哈希输出的问题

...                         'name' => 'Gohir.A01G185500.1_and_Gohir.D01G176300.1',                              'motifs' => [                                            {               ...