问题 老师，请教您一个生存分析的问题，为什么phenotype的删失数据天数一列中会出现alive time=0的情况,是病人还没开始实验观察就去世了吗？

问题 老师您好，我在做WGCNA分析时，无法打开'9.Module_membership文件，相关报错截屏和操作文件已发布，请问老师，是哪一步出了问题？该如何解决？谢谢老师。

trait.txtlncRNA_expressionMatrix.rar

问题 老师您好，单倍型分析的图是这样的，我关注的是蓝色框起来的标记，这个snp是否处于一个高度连锁的区域，属于左边的block还是右边的block呢

问题 老师您好，单倍型分析的图是这样的，我关注的是蓝色框起来的标记，这个snp处于一个高度连锁的区域吗，属于左边的block还是右边的block呢

问题 做有参转录组分析，在进行基因表达定量的时候，出现如下警告，请问老师这是什么原因呀

23900000 SAM alignment record pairs processed.Warning: Mate records missing for 270457 records; first such record: <SAM_Alignment object: Paired-end read 'A00224:87:H5WHYDSXX:1:2474:9118:3098' aligned to utg9_pilon_pilon_pilon:[3553256,3553424)/+>.24000000 SAM alignment record pairs processed....

文章 如何用R语言绘制进化树+热图

...同生物之间的相关关系的方法。 作用：通过绘制进化树分析可以了解所有生物的进化历史过程系统发育树的主要构成、找出不同物种间的进化关系、理解祖先序列与其后代之间的关系、估算一组共有共同祖先的物种间的分歧时...

问题 SSR查找及引物设计

...unescaped left brace in regex is deprecated here(and will be fatal in Perl 5.30),passed through in regex;marked by <-- HERE in m/([ACGT]{2})\1{ <-- HERE 0.5}/ at ../primer_design/my_misa.pl.txt line 126,<IN> chunk2.是怎么回事？需要怎么解决？

文章 进生物实验室之前，这本生存指南请拿好!

...色的实验仪器， 想到自己就要养各种细胞什么的， 是不是感觉马上要大展身手了！ 先别急， 这个时候有些同学可能会好奇：进入实验室之后，首先要学会的第一项操作是什么呢? 是DNA提取？还是PCR？或者是琼脂糖凝胶电...

问题 在进行转录组分析时，在自己的服务器上怎么使用以下命令，请老师帮忙解答；（没有root权限，docker镜像用不了，想在外部自己的服务器中使用）

agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl；agat_sp_keep_longest_isoform.pl

文章 CIBERSORT R代码分析

在R语言中运行Cibersort共需要三个文件，分别是（1）官方提供的22种细胞基因集“LM22.txt”；（2）自己的表达矩阵；（3）Cibersort代码。 （1）LM22.txt获取方法： 在Cibersort论文中（https://www.nature.com/articles/nmeth.3337#MOESM207）下载Su...

文章 BSA分析中MutMap 分析：95% 99%阈值置信区间是如何计算的

R语言代码有兴趣可以了解一下： ###########genotype#############################genotype<-function(){count<-0 if (population_structure=="RIL"){x<-runif(1) if (x<=0.5){count<-1}else{count<-0} }else{for(i in 1:2){x<-runif(1) if (x<=0.5){number<-0.5}else{n...

问题 老师您好 转录因子结合位点怎么预测

一个基因的启动子调控元件和转录因子结合位点是同一个东西吗  我想看一下我的基因启动子区有没有存在的调控基因表达的因子  应该怎么分析  试分析启动子调控元件吗还是分析转录因子结合位点

问题 老师，我看到我做的物种的全基因组WRKY基因家族生物学信息分析，已经有人做了，但我数据啥的都弄完了，我还能继续做这个课题吗

问题 老师你好，我想问我在通过cox回归建立lncrna预后模型，最后通过多因素cox回归分析得到的结果，发现有些基因的p值＞0.05，这些基因是不是要剔除

问题 老师您好，我购买了ceRNA分析的网上课程，在下载TCGA数据时出现问题，提示pre_miRNA_miRBase_v22.tsv文件找不到，想请教下老师这个文件怎么获得，谢谢！