问题 stringtie定量出现问题

命令如上。 报错信息如下：上面显示成功完成了，但是结果文件却是空的！不知道为什么！

问题 GAPIT使用异常

我在使用GAPIT时存在以下的异常，之前用都是好好的，代码和文件都没有变过，不知道什么原因，希望大家帮忙看看。

问题 基因家族建树

已经得到修剪后的序列，如何得到nwk格式得进化树得文件呢，我想通过下面得R语言脚本建树，因为得到基因数量只有五个不适合环状得树

文章 在R里绘制地图

...个包，进行地图的绘制。 ggmap 1 代码 ggmap包能够从多种在线地图服务（如 Google Maps、OpenStreetMap、Stamen Maps 等）获取地图数据，并且由于它是基于ggplot2可视化地图的拓展包，可以和与ggplot2无缝集成。 1.1 地图数据的获取 map <...

问题 genes数据与mRNA数据

我从教案里找到的R代码，只能从TCGA下载并提取genes，miRNA，lncRNA的表达数据。但是我的老师让我分析一下mRNA，所以我就不会了。难道我提取的genes的数据就是mRNA的数据吗？分析mRNA能不能直接用genes数据呢？

问题 gvcf转vcf

老师，我在进行gvcf转成vcf这一步出现了这个问题，不知道改怎么弄了，求助

问题 老师，您好！在进行python版mcscan 共线性分析时，当执行#绘制共线性图片：准备两个配置文件为输入文件，出现以下错误layout文件是如何制作和生成的，改了好多次都没成功，里面的内容是在txt里写入的还是用Excel编辑后保存为制表符分隔格式；还有mcscanx里面的染色体输入文件也是读入出错。

问题 meme分析后显示error at: maxw

进行meme分析，输入命令：/biosoft/meme/meme-v4.12.0/bin/meme ../pep_id-seq-F.fa -protein -oc ./ -nostatus -time 18000 -maxsize 6000000 -mod anr -nmotifs 10 -minw 6 maxw 100 显示：error at: maxw及以下信息，反复查看找不到原因，老师能否解决以下。 Usage:meme<dat...

文章 linux用户管理命令介绍

...觉少点音乐，所以又打开xmms 来点音乐；当然听点音乐还不行，MSN 还得打开，想知道几个弟兄现在正在做什么，这样一样，我在用beinan 用户登录时，执行了gedit 、xmms以及msn等，当然还有输入法fcitx ；这样说来就有点简单了，一...

问题 基因芯片探针与基因ID转化

基因芯片的探针与基因ID转化的过程是什么？很多教程里的GEOquery以及其他涉及到分析的包都没有办法下载。请问做过能不能推荐一个用可以下载的包进行分析的流程

文章 多组学联合分析—桑基图

...根本看不清逻辑…… 今天就给大家安利一款多组学整合分析的“可视化神器”——基因-通路-代谢物桑基图！它能把抽象的分子调控关系变成清晰的“流向图”，让你的科研逻辑一目了然，论文配图档次直接拉满！ 什么是基...

问题 虚拟机软件使用问题

 为什么按Hi+TAB不出现hisat软件的选项

问题 KAKS作图问题

1.请问如何调整kaks_plot.r包中参数才能使左边geneID上下不那么拥挤？ 2. 如何去掉下图中完全空白的部分重新作图？

问题 docker打不开镜像

老师您好！docker在运行，但是这个镜像连接不上。求老师解答。

问题 Circos画图时，想把连接的线换成不同的颜色，配置文件怎么改，基因ID的颜色怎么改？

.../ideogram>karyotype=/Users/823371123/Desktop/work/SBT/棉花基因家族分析/共线性分析/ghgrga/quan/chr.info.txt<links>    bezier_radius=0r    bezier_radius_purity=0.75    color=black    crest=0.5    <link>        bezier_radius=0r        bezier_radius_purity=0...