问题 基因组注释 genome.chain 文件生成问题

... 下面是我 genome.agp 文件中出现 fragment 的内容： Chr15   29259691        30651746        15      W       ptg000397l      1       1392056    + Chr15   30651747        30651846        16      U       100     scaffold        yes    ...

文章 癌症和肿瘤基因图谱（TCGA）计划简介

...瘤的基因组图谱，从而了解整个TCGA项目的可行性，这项工作称为TCGA试验项目。之所以选择这三种癌症，是因为三种癌症可以获得严格满足TCGA科学、技术以及伦理要求的高质量病人组织；而且这三种癌症的预后较差。TCGA试验项...

文章 corrplot包绘制相关性图，简单又好看！

... quietly = TRUE, warn.conflicts = FALSE))) } } 2.读入数据 #设置工作路径 setwd("~/work/03.deg") #读入数据 data<-read.table("fpkm.xls", header=TRUE,sep = "\t",check.names=FALSE,row.names=1) head(data) 基因表达量数据格式如下： ID A1-1 A1-2 A1-3 B1-1 ...

问题 R下载GEO数据没有显示GSM1625995 = col_double()

...ith column specification:cols(     ID_REF = col_character()     GSM1625995 = col_double()     ....     ....）File stored at: F:/GEO/20180605/Download/GSE66597/GPL6480.annot.gz     但是我下载时显示Found 1 file(s)GSE8205_series_matrix.txt.gztrying URL 'https://ftp.ncbi.nlm.nih...

文章 蛋白质纯化方法及注意事项有哪些？

...度差别分离：等电点沉淀法（由于蛋白质分子在等电点时净电荷为零，减少了分子间静电斥力，因而容易聚集沉淀，此时溶解度最小）；盐溶与盐析（利用一定浓度盐溶液增大或减小蛋白质的溶解度） （3） 根据电荷不同的分...

文章 docker 工具高级用法

...faidx dna-sequences.fasta 注意：-w 选项 指定容器中的进入的工作路径，把我们映射的路径指定为工作路径（/work）。然后把所有的输入文件都放在D:\samtools目录下，这时候我们的容器里面的/work 目录即是D:\samtools。这样就像运行本地...

问题 老师你好，我是在NCBI上面下载的枣的gff，以及蛋白质序列，做共线性分析的时候，perl get_gene_position.pl GCF_000826755.1_ZizJuj_1.1_genomic.gff AT.gff输出之后的文件与perl get_fa_by_id.pl AT1.gff GCF_000826755.1_ZizJuj_1.1_protein.faa pep.fa输出的文件是空的，应该怎么办。

文章 为什么华为、百度纷纷选择OKR,放弃KPI?

... OKR则是让你了解达成目标的方法，至于怎么去做好这份工作由你自己决定。 2、OKR更具公开性 在OKR体系中，所有的成员都可以随意查询其他成员的目标和KR，这不仅能够自然产生群体监督的作用，还可以合理有效地组建项...

文章 ConsensusClusterPlus 包对基因表达数据进行一致性聚类

...obs：行删除pairwise.complete.obs：成对删除，pairwisedeletion （2）calcICL函数：用法： calcICL(res,title="untitled_consensus_cluster",plot=NULL,writeTable=FALSE) 参数： resconsensusClusterPlus的结果title设置生成的文件的路径plot不设置时图片结果仅输出到...

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