有4个时期的二代数据 每个时期三个重复 一共12组数据 利用二代数据对三代数据进行校正，是选取 十二组中的一组还是都要进行校正
...小2.34G，contig N50 98.98kb，scaffold N50 2.98M。将大熊猫基因组数据和新测的82×数据一起进行重新组装，组装结果得到了大幅提升（contig N50由40Kb提升到126.71Kb，scaffold N50 由1.28Mb 提升到9.9Mb）。 根据大、小熊猫的基因组信息获得了14,25...
我从教案里找到的R代码，只能从TCGA下载并提取genes，miRNA，lncRNA的表达数据。但是我的老师让我分析一下mRNA，所以我就不会了。难道我提取的genes的数据就是mRNA的数据吗？分析mRNA能不能直接用genes数据呢？
...了方便大家能更加高效快捷地使用Logistic回归模型对自身数据进行建模，这里我们给大家提供了一个构建Logistic回归模型的R脚本。使用该脚本都只需要准备好相应的输入文件，再进行简单的命令行操作即可。 使用命令示例如下 ...
数据分列包括以分隔符号和固定宽度两种方式来分隔数据。 如图所示数据，我们要把以空格隔开的数据单独作为一列。 选中需要操作的数据，然后选择数据中的分列，在弹出的文本分列向导界面中选择分隔符号，然后下一步...
长型和宽型数据在数据分析中非常常见。 一般人们看到的以行为样本以列为变量的数据为宽型数据，非常适合我们查看和理解，例如下图： 但是在数据分析中，R语言常常需要将数据转换成长型数据才能便于分析和作图，例...
...说过测序的也是很难了，为了各种实验目的，自己去测点数据已经是稀松平常的事情了。但是马上要到来的公共数据挖掘时代，您是否有足够的认识？ 如果您还没有感知到的话，那让我来引导您回顾一下基因研究的不同时代及...
...展植物科学相关研究的科研工作者和学生群体而言，各类数据库和分析平台的建立和更新维护为植物的组学、功能、进化以及遗传育种等方面研究提供了丰富的资源，具有重要的理论指导意义和应用价值。通过总结目前已有的植...
GEO数据库是NCBI开发的基因表达数据库，主要接收通过高通量测序、基因芯片等方法获得的基因表达数据。除SRA数据库之外，GEO数据库也是目前文章投递过程中要求进行数据上传的数据库之一。 网上关于GEO数据库的上传教程良...
这个包里有一个函数separate可以直接将一列数据按需要分成几列 library(tidyr) df_2<- separate(df_1, 'colname', c("new_colname_1","new_colname_2"), ",") #例为将df_1表的colname列分成new_colname_1，new_colname_2两列，里面的数据以逗号为分隔符分割 ...
...的表达响应。 01 — 家族成员鉴定 文章选取了CottonFGD数据库中8个棉花品种参考基因组，并从Pfam数据库下载GT64的隐马尔科夫模型PF09258。通过HMMER搜索及Pfam、SMART、CDD数据库二次确认，最终共鉴定出39个GT64基因，分布在8个棉花...
...因组浏览器是集分析、可视化、Galaxy与一体的新一代在线数据分析和可视化平台。现有91个队列的1098个公共数据集包括 TCGA, ICGC, TARGET, GTEx, CCLE等都进行了标准化处理。因此不同的数据集之间可以组合比较。 热图的方式可以进行...
Broad GDAC对TCGA的结果进行了整理和深入分析，相关的原始数据和分析结果可以通过网页的方式进行查看和下载， 网址如下：http://gdac.broadinstitute.org/ 点击Cases可以查看对应的样本信息，点击Data可以下载对应的结果文件，点击Bro...