...是寄生在宿主中，不容易发现。采用高通量的测序方法，可以鉴定一些生物是否被病毒侵染，鉴定一些新的病毒。 采用小RNA测序鉴定病毒的基本策略主要包括以下3步： 1. 测序数据与宿主基因组进行比对，过滤掉来源于宿主的...
...程： https://bdtcd.xetslk.com/s/1VQOjQ 或者扫码二维码： 可以使用tassel GWAS分析软件 转换： perl /share/work/biosoft/tassel/tasseladmin-tassel-v5/run_pipeline.pl -Xms64G -Xmx64G -fork1 -vcf ../gwas_sub/snp.sorted.vcf -export ./hapmap -exportType Hapmap
用FAPROTAX数据库注释得到的功能表，可以在STAMP内进行组间差异分析，且软件绘制出的图片精美，可直接用于文章发表。 一.STAMP软件简介 1.STAMP软件是分析微生物物种与功能组成的可视化软件，提供了多种假设检验方法以及不同...
由于STRING数据库中没有丹参这个物种，所以我在搜索的时候选择了拟南芥。
老师您好！我画的图小于200Mb的可以标出基因在染色体的具体位置，但是基因在染色体上的位置大于200Mb的基因画不出来。new 1.txt谢谢您！
因为count值使用salmon计算非整数，无法进行稀疏曲线的绘制。如果审稿人问的话可以用read的稀疏曲线回复表明测序深度足够覆盖吗
...。 结果分析 1、共鉴定出7615种蛋白质，其中6319种蛋白可以定量，并进行了GO、KEGG、功能域预测、亚细胞定位等分析； 2、通过差异分析鉴定了116个差异蛋白DAPs，其中35个上调，81个下调； 3、对鉴定出来的所有蛋白进行GO分析...
...在学习练习python基础课程时，用jupyter notebook 读取一个不到5M，大概为20万行的文件，运行后浏览器内存占用持续飙升，整个电脑的内存占用由原来的20%飙升到80%以上，浏览器闪退，运行终止，图中所示为运行的程序界面。目前已...
...a.io/warnings/venv 以“root”用户运行pip可能导致权限中断，可以尝试使用虚拟环境 1，创建环境 python3 -m venv tutorial-env 如出现报错则先运行 apt install python3.10-venv安装一下包再创建环境 2，激活虚拟系统 source tutorial-env/bin/activat...
我一个星期还下载就好了，现在一直报错，这个是不是因为网的问题？我挂VPN会好些吗？ 2020-04-23T18:01:22 prefetch.2.9.6: Downloading via https... 2020-04-23T18:11:01 prefetch.2.9.6 int: transfer incomplete while reading file within network system module - Cannot ...
...包 # 直接输入软件包的名称即可 install.packages('pheatmap') # 可以指定repos 参数，设置为国内的R镜像仓库，提高下载速度 install.packages(c('dply','plyr','ggplot2'),repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/') 2. bioconductor 安装生信类相关的包 ...
vcftools可以对vcf文件做滑窗处理，并给出每个窗口内变异位点数量和多态性pi值。具体方法如下： vcftools --gzvcf raw.filtered.snp.vcf.gz --window-pi 125 --window-pi-step 5 --window-pi 指定窗口大小， --window-pi-step 指定步长大小 结果文件格式如...
老师您好，我从数据库下载了TCGA的 Methylation 450芯片数据，已取得基因的甲基化矩阵。请问矩阵数据可以直接使用了，还是需要先进行芯片间标准化处理？
在学习比较基因组课程中，我使用从葫芦库基因组数据库中下载的genome.fa,cds.fa,pep.fa,gff文件运行01.prepare_data.sh脚本时可以正常的获得gff文件，但是在提取cds和ped时，出现报错 报错如下
大多数GWAS分析采用自然群体，表型数据为编号后跟性状即可。那么有系谱记录的群体是否需要对表型做啥处理呢？还是把亲缘关系矩阵算进去就可以了？