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问题 请教各位老师,转录组测序出现了map率和外显子比对区域低的情况,没找到别的注释文件,推荐往下继续分析吗?

样本为水产动物

问题 单细胞测序数据对合并后的样本进行聚类分析时报错

老师您好!我在对整合后的单细胞测序数据进行降维聚类时,执行该代码后报错Rscript $scripts/seurat_sc_cluster.r --rds all.sample.merged.rds  \  --resolution 0.5 -d 30 \  -p pbmc   -o pbmc 报错内容为:Error: cannot open file '/share/work/biosoft/R/R-v4.0.3/...

问题 基因家族分析课程中,get_gene_weizhi.pl脚本运行后导出文件为空

老师您好, 我在“6.预测基因家族成员的顺势作用元件” 一课中,运行代码perl script/get_gene_weizhi.pl -in1 id.txt -in2 Cucumis_sativus.ASM407v2.41.gff3 -out gene_weizhi.txt后,导出文件为空。我检查了id文件和gff3文件的基因标签是一致的,以下...

问题 基因家族串联重复基因 tandem和segmental的区别与联系?

第一条:《基因家族分析实操课程》里面面的串联重复基因的分析结果,分析的结果只有串联重复基因,串联重复基因于tandem和segmental是是一个意思啊? 第二条:MCScanX最后分析的结果是一样的吗?MCScanX里面还有tandem和segmental...

问题 老师,您好,我想请教一下,在做生存分析的时候,为什么训练集和测试集要对半分啊?有一些又是70%和30%的分法?

问题 在做基因家族分析时,画circos图的时候,只画出了一半,背景没有,基因标签也没有,路径额检查了,出现了下面的报错

问题 全基因家族分析获得基因在染色体上的位置信息时,为什么在2A.2B2D上没有出现基因,表格中是有的呀?谢谢

问题 老师你好,我是从NCBI下的GFF文件,在做基因结构分析的时候,UTR没有标注,只能提取出来CDS区域,请问如何添加UTR区呢?

问题 老师您好,我弄基于转录组的基因家族分析时,我已经知道了基因家族的id,如何从CDS的fasta文件中提取出序列。

问题 WGCNA分析,导出cytoscape的.nodes文件 但是打开txt文档里面的内容是空白的,代码中参数有基因的名字,恳请各位大佬帮忙解决问题。

问题 老师您好,请问同GSE号的数据可以联合起来做WGCNA分析吗?该如何将同的Gene_expressionMatrix文件都加进去?谢谢老师。

问题 按着课程做,用的也是组学的数据,KEGG富集分析,只生成normal_vs_tumor_degene.id.map.tsv文件

问题 按着课程做,用的也是组学的数据,KEGG富集分析,只生成normal_vs_tumor_degene.id.map.tsv文件

问题 Arabidopsis_thaliana.TAIR10.56.gff3.gz 课程资料发我的gff文件里面没有parent信息,影响基因家族分析吗?

问题 可以分析多个序列中两个序列的相似性吗?下图有多个序列,这么比对后,发现两个一样的序列都无法配对。如何比对多序列的两个序列。