找到约 15 条结果

文章 Linux下判断数值大小

...学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读 6. 更多学习内容:linux、perl、R语言画图,更多免费课程请点击以下链接: htt...

文章 R语言跑循环,如何跳过报错信息?

...循环体,并在屏幕上打印出报错信息,比如这样: 那怎么能让错误信息被忽略掉,接着执行下一次循环指令呢,可以使用try()函数: for () {   err = try(想要执行的函数体)}#比如:for (i in 1:length(flies)) {   err = try(eQTpLot(GWAS.df...

文章 同源基因概念(直系同源 vs旁系同源 )

...统方法都有局限性,如今研究的是分子进化。也就是利用软件,从分子水平上构建物种的进化树。这里说的分子水平是指 DNA、RNA、以及蛋白质序列。 分子进化理论是 1962 年美国科学家 Linus Pauling提出的。这种理论与传统研究方...

问题 泛基因家族分析之基因家族成员选择压力分析

...复修改数据),都没有出过问题,请问是什么问题呢,该怎么解决?

问题 基因家族共线性绘图时,画出来的图上只有一对基因连了红线

... 分析文件中的一对基因显示在图上。是不是那些文件得怎么合并在一起呢?谢谢

文章 GSDS指定序列顺序

...学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读 6. 更多学习内容:linux、perl、R语言画图,更多免费课程请点击以下链接: htt...

问题 绘制基因表达量热图需要对生物学重复样品的表达量取平均吗?取平均值要如何取?

下面是某篇文章中的热图,原始转录组数据是每个处理都有三个重复,但热图中却没有体现出重复,是对三次重复表达量取了平均值绘制的吗?取得话应该怎么取呢?

问题 请问:要注释的fa文件同源注释的时候,所选的两个物种没有结果,注释迁移失败。应该如何注释

我所注释的物种比较小众,是真菌。拟南芥等基因组比较大,老板说不用跟他对比,所以我找了两个他的同源物种但是并没有结果。本物种的参考基因组没有相关的gff文件,我应该怎么注释。

文章 seqkit计算基因组大小

...学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读 6. 更多学习内容:linux、perl、R语言画图,更多免费课程请点击以下链接: htt...

文章 Perl语言里面$.代表什么意思

...学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读 6. 更多学习内容:linux、perl、R语言画图,更多免费课程请点击以下链接: htt...

问题 我在运行MCScanX时报错,以下是我的输入文件和报错截图

...图 老师,我想问这种scaffold水平上的共线性分析,应该怎么改配置文件

问题 用R语言绘制旭日图但无法控制配色

...用R语言绘制了一个旭日图,但是没有办法配色,不管我怎么设置配色,图的颜色都是一样的渐变色,想请教一下您看看是什么原因。代码和绘图结果如下: mypalette<-c("#8C8C8C","#87CEFA","#FF00FF","#B22222","#EE9A49","#858585","#080808","#836FF...

问题 cnvnator -root ${i}.root -tree $workdir/3.map/result/${i}.sorted.dedup.bam -chrom 4

你好,我的参考基因组scaffold有24条,做CNV分析时,命令改怎么调整呢?

问题 转录组分组间差异基因分析

...存在的取样时候的问题,基于现有数据,这种情况一般该怎么处理?是否需要放宽差异基因数较少的阈值范围,比如差异倍数放宽至1.5倍。 2 公司给我的结果,只给了A vs B,和 B vs C两组差异分析结果,并未给出A vs C这两个时期...

问题 群体遗传进化课程中基于pi用R脚本绘制曼哈顿图请问更改色板颜色的具体指令

老师您好,        我按照教程输入相关指令,但是怎么改都会报错无法识别颜色名字,起初我以为是其他包中的颜色无法识别, 后来使用了默认的四个颜色,也用了ggplot2包自带的色版,都不可以,应该是代码没输入正确,请...