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问题 docker运行qiime1时按照教程进行到章节2课时6时,即聚类生成OTU-denovo时老是报错,查看类似问题后,升级了运行内存为70g,同时将教程内的30多个样本减成2个样本,FASTQ格式还有qimme格式检查都正确,依旧报错,报错内容如下:Segmentation fault

docker运行qiime1时按照教程进行到章节2课时6时,即聚类生成OTU-denovo时老是报错,查看类似问题后,升级了运行内存为70g,同时将教程内的30多个样本减成2个样本,FASTQ格式还有qimme格式检查都正确,依旧报错,报错内容如下: pic...

问题 镜像安装

老师,您好!我尝试跟着教程执行docker pull omicsclass/pan-gene-family:v1.0命令行时根本下载不了镜像,请问一下您可以发一份本地版本镜像文件吗

问题 nextpolish报错

老师,您好,我用的大讲堂的基因组组装的DOCKER,在用nextpolish的时候提示这样的报错,不知道是什么原因,麻烦看下,谢谢1

问题 nextpolish报错

老师,您好,我用的大讲堂的基因组组装的DOCKER,在用nextpolish的时候提示这样的报错,不知道是什么原因,麻烦看下,谢谢1

问题 aspera下载报错

docker中用aspera下载ENA中的数据,提示授权失败,请教原因和解决方法。

文章 基因家族分析课程更新2.0

...新,因此我们更新了基因家族镜像2.0,下载使用方法: docker pull omicsclass/gene-family:v2.0docker run -it --rm omicsclass/gene-family:v2.0 5.课程目录: 课程观看链接:https://bdtcd.xet.tech/s/1BAqPp 参考文献: Zhang, Z., Xiao, J., Wu, J., Zhang, H., Liu,...

问题 jcvi安装报错

ImportError: cannot import name 'HTTPSConnection' 另外还想问一下,docker课程里面是否具备collinearscan软件的安装与使用

文章 eggNOG批量注释基因组数据库

... eggnog.db64fefa838833a6f3e220a06fb9d403cd  eggnog_proteins.dmnd 利用docker工具eggnog进行注释,以拟南芥为例: #非模式物种GO KEGG注释与富集分析 #eggnog 数据库下载之后解压,放到一个目录中 #启动镜像 #docker run --rm --cpus 8 -m 16G -it -v /share/...

问题 镜像安装,镜像安装

老师,您好!我尝试跟着教程执行docker pull omicsclass/pan-gene-family:v1.0命令行时根本下载不了镜像,请问一下您可以发一份本地版本镜像文件吗

问题 重测序

我在重测序call  SNP 的时候,为什么跑一段时间这个镜像就找不到了?但是任务和文件怎么还在更新? [us001@omicsclass-a06  16:17:00 ~]$docker ps CONTAINER ID  IMAGE       COMMAND     CREATED     STATUS      PORTS       NAMES

问题 kaks转换报错

老师,您好! 我目前是在docker的bio-linux里操作的,我在做aln转换axt格式时老师报错,请问如何解决。说是没权限,但是我已经再root里面给了777权限,但还是报错。

问题 镜像加速接下来怎么操作

看了docker在windows系统和mac系统中安装 - 组学大讲堂问答社区 (omicsclass.com)这个帖子,但页面不一样,不知道接下来怎么操作,求解答,感激。

问题 为什么启动不了镜像?

docker run -it -m 3G --cpus 1 --rm -v D:/reseq:/work omicsclass/reseq:v1.1 这条命令启动不了镜像这是为什么?输入进去以后就会报错invalid option type work

文章 基因家族docker 镜像使用方法

##################################################进入docker虚拟机,注意自己安装的docker版本##################################################下载基因家族分析镜像#docker pull omicsclass/gene-family:v1.0#docker desktop 进入虚拟机命令#docker run -m 3G --cpus 2 --rm -v D...

文章 6分+文章告诉你2021基因家族分析文章还好发!

...了一次重大更新!更新内容如下:1. 分析环境采用全新的docker虚拟机docker是一种更好用的虚拟机工具,其体积小巧,可以在任何操作系统中安装运行,使用更加方便。同时,组学大讲堂不再更新基于vbox的biolinux系统。但为方便刚...