请问： 1.通过docker进行基因家族分析，是不是每次退出终端都要exit。然后再次进入终端后，先要设置环境变量workdir=/work/my_gene_family scriptsdir=$workdir/scripts/。 2. docker image ls 查看后台镜像显示有“omicsclass/gene-family v2.0”是不是...
...，这里我们组学大讲堂发布了专门用于微生物扩增子分析docker镜像，里面内置了几乎所有要用到的关于多样性分析的相关软件，方便大家使用，只需安装docker并下载该镜像即可，避免繁琐的软件安装问题； 扩增子分析流程介绍 ...
...约学习成本。 识别以下二维码直达课程： 如果安装过docker，可不用安装vbox的bioLinux； docker的学习链接：https://zzw.xet.tech/s/3Rcvt0 延伸阅读 R语言基础绘图 | R语言快速入门与提高 | 学基因家族分析 | 基因家族分析...
...图报错：https://www.omicsclass.com/question/6010 使用方法： docker pull omicsclass/pop-evol-gwas:v2.0docker run -it -v ~/gwas:/work omicsclass/pop-evol-gwas:v2.0 如果需要用到最新的软件分析数据可以使用这个2.0版本的镜像， 这个已经更新到百度云盘中...
...级：支持一个分组文件做所有差异分析 使用方法： docker pull omicsclass/rnaseq:v2.0docker run -it -v ~/rnaseq:/work omicsclass/rnaseq:v2.0 如果需要用到最新的软件分析数据可以使用这个2.0版本的镜像，老用户重新下载示例数据压缩包 ...
下载tripal官方镜像： docker pull tripalproject/tripaldocker:latest 下载tripal模块: git clone https://github.com/tripal/t4d8 启动镜像运行网站: docker run --publish=80:80 --name=t4d8 -tid --volume=/web/t4d8:/var/www/drupal8/web/modules/contrib/tripal tripalproject/trip...
我个人的设备：CPU 2*40， 内存64G. docker设置 CPU40，内存54G docker run -it -m 50G --cpus 35 --rm -v D:/ampliseq:/work omicsclass/ampliseq:v2.0 然后跑 ### 物种注释 16S/18S #全长作为分类数据库： qiime feature-classifier classify-sklearn \ --i-classifi...
Error response from daemon: pull access denied for it, repository does not exist or may require 'docker login': denied: requested access to the resource is denied. 麻烦老师解答一下，之前听docker blast那里挺顺利的，在基因家族分析课这里卡住了
课程中myseql镜像是用docker启动的（如下），但是如果用singularity启动，相关的命令参数如何更改？我能查到的是-v对应singularity中的-B，其它-p --name -e -d 该如何修改？ mysql_server.sh脚本文件中： #启动镜像 docker run -p 3399:3306...
...-s /work/ara_pangenome/pangenome* .#启动服务可视化。记得启动docker时加上端口映射 -p 3000:3000 cd /share/work/biosoft/sequenceTubeMap/sequenceTubeMap npm run serve #启动服务启动服务之后，打开电脑网页，输入运行这个服务的IP地址加端口号：h...
...做26个玉米基因组的基因家族成员鉴定等分析时，用的是docker run -it -m 3G -v/home/us132/pan-gene-family:/work localhost/omicsclass/pan-gene-family:v1.0镜像，而做泛基因集列表时用的是docker run -it --rm --name pangene --group-add keep-groups -v /home/us132/pangene:/...
...ggnog.db64fefa838833a6f3e220a06fb9d403cd eggnog_proteins.dmnd 2）利用docker工具搭建EggNOG-mapper注释分析环境，以拟南芥为例： #下载安装eggnog的docker镜像 docker pull omicsclass/eggnog:latest #启动镜像 #注意这里的 -v 使用了两次 docker run --rm --cpus 8...
用docker镜像下载TCGA数据，只得到临床信息， 代码报错
docker运行qiime1时按照教程进行到章节2课时6时，即聚类生成OTU-denovo时老是报错，查看类似问题后，升级了运行内存为70g，同时将教程内的30多个样本减成2个样本，FASTQ格式还有qimme格式检查都正确，依旧报错，报错内容如下： pic...
我用了omics docker 里SARtools下载数据，但是发现容器无法联网