找到约 15 条结果

问题 基因家族分析时搜索的基因数很多,只有少数没有组装染色体水平的基因,请问可以不要这种基因吗

问题 学习中遇见的问题

...提示没有导入bio-linux的ova包。但是,问题是我已经导入了这个ova包,下载地址是百度云的地址https://pan.baidu.com/s/1ui9ndOsjbtgHrJoxxOcTMQ。操作时按照linux生信分析环境搭建Bio-linux一步一步操作的,现在提取Motif操作是按照老师的方法...

文章 细胞培养步骤梳理:细胞复苏、传代、冻存中的细节问题

...基(DMEM、RPMI1640、MEM等)和10%胎牛血清(FBS);为了防止污染,可以加1%双抗! 常见问题解答: Q:针对不同细胞,细胞培养基配方一样吗?如何获知呢? A:不同细胞的培养基是不同的。一般ATCC购买的细胞,针对不同细胞株,会有详细...

问题 甲基化图谱可以直观的展示整个基因组甲基化的情况,绘图前我们需要准备如下文件

这个文件怎么生成?我用bismark提取甲基化信息,怎么生成那个文件用于全基因组甲基化图谱分析

问题 请问泛基因家族分析实操课程中老师用的泛基因列表为什么和课程泛基因集构建得的列表不一样呢?

老师课中 用的泛基因列表为上面这张,我根据课程泛基因集构建做出的表为下面这个,为什么格式不一样呢?另外,课程中用的结构变异分析结果以及基因表达量数据表格,老师说提前下载的,请问哪里可以下载呢?

问题 关于genecode的ID提取

...点出入,不知道如何择选的,因为genecode上面没有单独mRNA这个数据包 根据视频下载的是核染色体的基因注释,这就使得非编码和编码的都包含了,这个从我打开文本可以看出是这样的。 然后我想获取编码RNA,我之前没仔...

文章 如何有效利用企业资源,发挥Scrum最大优势?

...企业产生多大的影响,可以利用步骤1中的方法来判断。 这个问题在哪些方面使企业与其目标背驰?这个问题会耗费企业多少资金?从长远来看,牺牲掉的是什么? 第4步:让企业参与有目的、经验性的变革 你无法改变某个...

文章 Docker Hub结合Github自动化构建多版本镜像

...上创建一个Docker构建项目,在里面实现Dockerfile。 该步骤可以在本地完成,然后提交自己的Github仓库中。 然后继续进行第一个步骤,在右侧选择Github中的构建仓库: 推送更新,自动构建 每当Dockerfile有新的修改推送Gith...

文章 和导师闹翻怎么办?当代研究生的日常困境

...自己做事的风格,有自己对待世界的态度, 我们选择了这个导师,其实就意味着我们在这段时间内需要去适应和接受这位导师的世界观和人生观。 所以,多包容导师身上身的弱点与不足吧,我们要做的是充分利用导师身上...

文章 人工智能(AI)在微生物组中的应用-随机森林分类与回归预测

...应一致;(3)重复(1)-(2)过程,获得大量决策树;这个过程称之为:bootstrap aggregating(bagging)。 (4)利用Out-Of-Bag(OOB)方法检验所有决策树投票权重及评估决策树的准确度。oob error = 被分类错误数 / 总数 (5)对于测...

问题 有老师会解决这个问题嘛,新手怎么不会解决,从gtf文件中提取splice sites错误,报xa0错误

文章 Orthology 定义

...复制,即一个正本和一个复本。那么,在老鼠基因组中,这个基因的正本会保留在原始位置上,而它的复本会移动基因组的其它位置上。啮齿动物中互为旁系同源关系的基因正本和复本,与人类中的同源基因又都为直系同源关...

文章 进化树构建的方法及原理详解

...他们构建一棵系统发生树。这样就可以从树上推测出谁和这个新细菌的关系最近。系统发生树还可以预测一个新发现的基因或蛋白质的功能。系统发生树还分为有根树和无根树(下图),顾名思义,有根树就是有根,无根树就是...

文章 蛋白质表达系统的类型及其优缺点

...指由宿主、外源基因、载体和辅助成分组成的体系,通过这个体系可以实现外源基因在宿主中表达的目的。   1、宿主。表达蛋白的生物体。可以为细菌、酵母、植物细胞、动物细胞等。由于各种生物的特性不同,适合表达蛋...

问题 老师这个示例文件夹里没有东西,我cd01.prepare_data文件夹下里面时候空的