问题 老师您好，做基因家族分析有几个问题不明白想问问您：（1）实在找不到组装到染色体的基因组，可以用scaffold水平的画基因重复性图吗？会不会影响发文章 （2）能不能分析两个比较有相关性的基因家族或者结合转录组分析，增加一点文章接受几率？（3）用hmmsearch筛选蛋白，构建新模型，再筛选，筛出来200多个蛋白，但是alignment之后发现保守结构域差别很大，gap特别多，是出了什么问题吗？

问题 老师你好，我想问信息检索的问题，同样查询NBS蛋白序列，想用他俩的NBS序列与拟南芥的NBS序列做blastp。搜索页面出现的关键字不一样？他们有什么关系吗？我该怎么下载？谢谢老师。

问题 您好，请问您paircoil2安装问题解决了吗，我安装也出现了和您类似的问题，我也按照那个文件要求把配置文件放在家目录下，但是仍然命令使用不了，网上实在搜索不到相关信息，只能请问您了，望回复

文章 数据分析实用技能—Excel函数使用—VLOOKUP：数据批量提取及数据合并

...配方式，同时要求查询区域的首列按升序排序。 1. 批量筛选特定基因的表达量 做了转录组数据分析，通常公司会给我们一个所有基因在所有样本中的一个基因表达矩阵文件。有时候我们通过一些方法或者手段筛选到了一些基...

文章 Cufflinks,Stringtie 合并转录本之后，如何筛选新转录本？

...行合并，生成一个统一的基因注释GTF文件。 那我们需要筛选出新的转录本，那该如何筛呢？这个可以从GTF文件的class codes着手，该信息记录了每个转录本相对于已知转录本的位置信息。  1=Complete match of intron chain2cContained3jPotenti...

文章 Sci-hub一键下载文献-真香！内有详细设置教程！

...每一次都需要复制文献标题，然后再使用Sci-hub网站进行搜索的过程又不太方便。那么，有没有Sci-hub一键下载文献的方法呢？答案是“有”。今天小编就给大家介绍一下如何使用Sci-hub一键快捷的下载文献。 一键使用Sci-hub下载文...

问题 老师，我筛选了20个顺势作用元件，但是在作图的时候，下面的脚注没有完全显示所有的顺势作用元件，我应该怎么做才能把20个顺势作用原件的脚注都显示上

文章 研究miRNA必备的分析网站汇总！

...所以对软件的要求也非常的高。 TargetScan TargetScan是通过搜索和每条miRNA种子区域匹配的保守的8mer和7mer位点来预测靶基因。 http://www.targetscan.org/miRandamiRanda是John等于2003年5月开发的第一个miRNA靶基因预测软件。miRanda适用范围广...

文章 2023年秋季线下/直播培训火热报名中！

秋季是收获的季节，回首2023，竟已接近尾声，这一年你是否也收获颇丰？假如你觉得还有所欠缺，那么你又如何充实自己？ 古人云“好学者如禾如稻，不好学者如蒿如草。”每个人每天都有成长，收获却取决于你选择的方向！...

文章 转录组后续实验怎么做？

...验继续深入挖掘转录组数据呢？为了求证这个命题，小编搜索了18年三月最新的转录组文章，发现了两篇以积雪草（Centella asiatica）为材料的文章，并且是以同一个转录组数据连发的两篇SCI（2017年12月一篇；2018年3月一篇）；这两...

文章 java 安装以及环境变量配置

...OME%\lib\tools.jar;（注意的是最前面的".;"  因为WINDOWS默认的搜索顺序是先搜索当前目录的，再搜索系统目录的，再搜索PATH环境变量设定的 ） 查看是否安装成功以及 JAVA版本方法：能够正确打印出版本信息即为安装成功，不然...

问题 请问老师，我这个perl处理文本的代码中第25行的搜索替换可以那样写吗，其中可以替换整个变量吗，一直运行不出来，谢谢您啦。目的是使下面的blast结果中出现两个菌种的部分一行拆成两行，实现规整化。

问题 老师，您好，学习咱们得基因家族分析课程。按照咱们得代码运行，发现第二次搜索hmmsearch，发现输出空吧，我把以前生成的文件和你们提供的demo比了一下都一样，可是WRKY_domain_new_out.txt空白

问题 如何在Windows PowerShell基因组GFF文件中搜基因的个数呢？比如说在斑马鱼中搜索DMBT1基因，搜到了一个，想搜还有没有这个基因，如何搜下一个呢，怎么操作呢？需要输入什么指令呢？

文章 rbsurv对生存分析的单因素进行鲁棒性检验

...######################## # 单因素中显著的基因，进一步鲁棒性筛选(此时选择全部的样本比较好) sign_gene_expr <-t(exprSet[sign_gene_id]) dim(sign_gene_expr) # 将矩阵的值转换成numeric rust_test<-matrix(as.numeric(unlist(sign_gene_expr)),nrow=nrow(sign_gene_exp...