inferCNV用于探索肿瘤单细胞RNA-seq数据，分析其中的体细胞大规模染色体拷贝数变化(copy number alterations, CNA)，例如整条染色体或大片段染色体的增加或丢失(gain or deletions)。工作原理是，以一组“正常”细胞作为参考，分析肿瘤细...
...数设置的），还是数据输入时必须要有超过两个样本才能用conet做图？ Error message: java.lang.IllegalArgumentException: After filtering, less than 3 columns remain in the input matrix! at be.ac.vub.bsb.cooccurrence.conversion.MatrixFilterer.filter(MatrixFilterer.java:37...
... 11 blksz 磁盘块的大小 总是0 12 blocks 文件中的块的数量 总是0 例子：获取某个文件的创建时间和大小， my @array = stat("test.html"); print "$array[10]\n"; print "$array[7]\n"; 此外，我们在网易云课堂上有各种...
...用同一个文件，就会出现这个错误；解决方法：在命令行中添加-disable_auto_index_creation_and_locking_when_reading_rods这个参数，表示禁止索引文件的自动生成和锁定；
... 数据库下载和处理生物序列数据。 在首次使用该工具包中的fasterq-dump将srr转换成fastq格式的文件时，出现了如下提示信息： 这提示需要进行配置。可以使用vdb-config –interactive通过互动模式来选择相应的选项，使用vdb-config -h...
...示集合（sets）之间的交集关系，特别适合于高维度数据中多重集合交集的可视化。它是传统Venn图和集合图的替代方案，特别在集合数量较多或交集较复杂时，更加清晰和实用。Upset图的应用广泛，常见于生物信息学、统计学、...
...E fi # Wait for 10 minutes sleep 600done 可以把该脚本用&挂在后台，该脚本可以让系统资源异常占用或磁盘快满的时候通知你
做完转录组测序分析，从公司拿到的结果中一般都会有GO富集分析的结果文件。公司的分析都是标准化的，相应的GO富集分析图上展示的一般是前20位富集程度最高的GO条目，没有经过qvalue值的筛选。如果你想筛选一下qvalue值或者...
各位老师，我在绘制进化树的过程中，使用命令ggtree.r -t fasttree.nwk -f $GROUP -g Group -n fasttree，运行后报错，出现下图报错，请问老师，我应该怎么处理呢？
微生物多样性分析当中，三元相图Ternary图可以展示物种在不同分组当中的相对丰度的大小： 三元相图当中，不同的点代表不同的属，当然也可以是其他的分类水平，点的大小代表了该属在不同分组当中平均丰度，点的颜色代表...
...科研人自己懂。 在《Nature》的一项全球青年科学家调查中，38%的受访者报告每周工作时间超过60小时——其中9%的人表示工作时间超过80小时。 在很多外行人看来，科研工作者是聪明、神秘、高端，分分钟改变世界， 而实际...
...检测。 网站地址：http://wishart.biology.ualberta.ca/cgview/ 使用过程：（以一组基因分析为例）： 1. 文件准备以及格式： 1） 基因组文件：为细菌的基因组序列（fasta格式，或者gbk格式） 2） 标记基因文件：表头必须...
...因染色体位置图 （https://www.omicsclass.com/article/397），图片中可以直接显示基因位置数据，此外还可以转换成标尺的形式显示位置： 设置初始图片后，选择Tools-->Chart options-->Loci -->Positions设置Absolute position时 注意下方的Decim...
又一个七天长假即将来临， 大家想象中的画风都是这样的吧： 但，想象总是好的， 总有一群小伙伴们在节假日依旧坚守在学习第一线， 还在努力奋斗，认真看文献写文章， 到底是什么支撑大家在祖国母亲生日的时候...
...图，常用来展示数据的整体分布情况，也是目前科研论文中经常出现的一类图形。标准的箱线图包含几个重要的元素，如下图所示，包括下四分位数（第25%数据的大小）、上四分位数（75%数据的大小）、中位数等（中位数大小）...