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文章 circos-基因组圈图调整标签文字重叠

...位置较近，很容易导致文字重叠，在绘图时可以利用plot中对应的参数进行控制： （具体请结合参考：http://circos.ca/tutorials/lessons/2d_tracks/text_labels1/images    和  http://circos.ca/documentation/tutorials/2d_tracks/text_labels1/lesson ）        ...

文章 保姆式教程！手把手教你使用Simplot，绘制高大上的序列相似性图片

...当参考序列的点图呈现近似平行线时，说明目的序列与其中某条参考序列的序列高度相似，不存在重组信号；（2）当参考序列的点图呈交叉时，说明可能存在重组信号。如下图所示，11株病毒菌株在整个基因组长度上表现出高度...

文章 项目管理软件的应用现状与发展趋势

...务界面操作复杂，技术难度大，用户体验差价格高昂，小中型企业难以承担售后服务没有保障虚假宣传，混淆视听集成性差，员工需使用不同的信息管理系统相互切换，影响效率 因前期管理软件质量的参差不齐，所以难以得到...

文章 heatmap_group_plot.r 分组热图展示免疫侵润结果

...明： 结果展示： 注意事项： 样本分组 metadata文件中，不要有NA值；不然会报错： Error in names(ann_colors[[opt$group[i]]]) <- unique(mygroup) :   'names' attribute [12] must be the same length as the vector [11]

文章 R语言文件目录操作

...据时，通常需要对文件或文件夹进行操作，下面将R语言中处理文件和文件夹的常用函数整理一下。 1、工作路径 getwd()        列出当前工作路径； setwd(dir)    设置工作路径，参数dir是要设置的路径。 2、列出目录下...

文章 Excel数据分析技巧之双因素方差分析

...”表示的是PH值，“列”表示的是温度处理时间，从结果中可以看出不同的PH值对种子萌发率有极显著的影响，而温度处理的时间长短对种子萌发率没有显著的影响。（当F＞Fcrit，表示有显著或极显著差异；当P-value＜0.01，表示有...

文章 Excel数据分析技巧之双因素方差分析

...”表示的是PH值，“列”表示的是温度处理时间，从结果中可以看出不同的PH值对种子萌发率有极显著的影响，而温度处理的时间长短对种子萌发率没有显著的影响。（当F＞Fcrit，表示有显著或极显著差异；当P-value＜0.01，表示有...

文章 微生物与环境因子，代谢物，功能等相关性分析linkET

...关性#通过 spec_select 指定数据组范围，例如这个示例数据中，微生物矩阵的第1-22列是物种丰度数据（指定名称 Taxonomy），#第23-40列是基因丰度数据（指定名称 Function）#默认情况下，对 spec 计算 Bray-Curtis 距离，对 env 计算 Euclidean ...

文章 Seqtk | 一个快速处理FASTA和TASTQ文件的工具

...序列； seqtk subseq in.fa reg.bed > out.fa 09. 根据reg.bed文件中的区域将对应序列转换成小写； seqtk seq -M reg.bed in.fa > out.fa 10. 直接对FASTQ文件进行序列随机提取10000 reads，在提取R1和R2两个文件的时候，需要-s值一致，才能使提取...

文章 三代数据SV检测软件安装与使用——cuteSV

...优势，但是由于数据分析算法、软件还处于不断开发更新中，当前还没有公认推荐的软件。这里为大家推荐一款国人开发的三代数据SV检测软件—cuteSV。该软件同时支持目前三代测序领域的两大平台PacBio和ONT的数据，此外，还兼...

文章 本科生到底要不要进实验室？怎么进实验室？

...观性， 导师的联系方式一般在网站上都会有，可以直接用简洁的邮件或短信与其联系，或者联系导师实验室的师兄师姐， 毕竟，不管是导师，还是师兄师姐，都还挺喜欢有个小白来“打打杂”。 本科阶段进实验室要学什么? ...

文章 LENS:人的基因相互作用分析在线工具

...保存（提供的如果是单基因列表，红色为提交的基因列表中的基因） 网络图下载可保存方式如下： 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家...

文章 Ka/Ks与进化选择压力

...然选择，而非同义突变则受到自然选择作用。在进化分析中，了解同义突变和非同义突变发生的速率是很有意义的。常用的参数有以下几种：同义突变频率 (Ks)、非同义突变频率(Ka)、非同义突变率与同义突变率的比值(Ka/Ks)。如...

文章 biolinux操作系统简介

...的软件或包，也可自己将biolinux软件源加入Ubuntu软件列表中，利用Ubuntu的apt-get安装这些软件包。常用软件列表见表1，附中文简介。 表1. Bio-linux8集成主要生物信息学软件简介 act13.2-1A DNA sequence comparison viewer based on Artemis基于Artem...

文章 R安装units包报错解决方法

...ts2-devel 检查udunits2库路径是否正确设置。您可以在终端中执行以下命令，查找libudunits2.so的路径： find / -name "libudunits2.so" 再次安装units包即可通过了。