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问题 不同物种之间的共线性分析

...面的过程都和顺利，所需文件 以及SM.bed 都是对的，请问怎么解决?

问题 泛基因家族系统发育树

...亚类呢，如何说各个亚类的功能，在写文章时，不知道该怎么说明这个结果，麻烦老师帮忙指导

问题 structure_plot.r 停止调用

...ion halted  执行已停止 structure 运行显示版本停止运行，怎么修改?

文章 eQTL结果使用coloc共定位分析

...ryCatch(coloc.abf(d1, d2), error = function(e) NULL) 得到的结果文件格式如下 chr start end Gene nsnps PP.H0.abf PP.H1.abf PP.H2.abf PP.H3.abf PP.H4.abf --- -------- -------- ------------ ----- ----------...

问题 如何TajimaD筛选选择区域内的受选择基因的问题

老师，您好，请问脚本绘制完Tajimad之后，生成了一个TajimaD.smoothline_data.txt文件，但是并不像之前有筛选好的top5%或者1%，脚本里是不是没有加上？那么我们怎么筛选，可以根据这个文档手动排序吗？

问题 手动筛选100kb以内的串联重复，两条染色体的起始位置有点重复

请问老师这该怎么解决

问题 WGCNA中运行给的filter代码后显示没有变量 如何解决

老师，请问用自己的数据，前面处理都没有问题，运行filter部分前还是'data.frame': 15 obs. of 24897 variables，运行给的filter部分代码后，总是显示0 variables，请问该怎么解决呢？谢谢

问题 老师您好，我在文件共享时出现不能共享的问题，具体操作如下：

sudo mount -t vboxsf windows-share /home/manager/share 结果为：/sbin/mount.vboxsf: mounting failed with the error: No such device，该怎么解决，谢谢

问题 vennerable 三维及以上如何实现按数据大小比例并自定义配色方案

再利用vennerable包VennThemes函数时，我不知道怎么分face，因为三维及以上，其交集的个数很多，请教大家一下！

问题 如何通过GWAS的曼哈顿图结果筛选基因？

...件中进行检索，不知道文章中曼哈顿图上标注的基因都是怎么来的，求助

问题 juice box调整hic挂载数据

...,不属于我的染色体（已经划分出20条了），这些小的片段怎么处理呢，3d-DNA中-m 是选单倍体好呢，还是二倍体模式，我的材料是自交的二倍作物，谢谢 -m --mode haploid/diploid 单倍体/二倍体模式（默认单

问题 老师，您好，不能用GFF文件提取exon位置信息文件，结果文件是空的

我的GFF文件是这样的，NCBI下载的，请问下该怎么处理啊老师？

问题 如何找到差异基因的整体通路以及实现可视化？

...功能注释可以找到这图中通路的上某几个基因，想知道要怎么像他一样把通路整体找到然后画出来？是要自己把每个相关的基因搜出来，然后到KEGG上找吗？还是可以批量进行？搜的时候是要输进什么去搜？

问题 你好，想求助一下关于在CGView中进行COG分类的文件问题

您好，我看有个帖子下有您关于CGView COG文件注释的问题，正好我也在弄这个，想请问一下具体是怎么操作的呢，希望您能回答一下，谢谢

问题 问一个玉米基因芯片ID转换的问题

...无法下载到对应的转换文件（http://maize.jcvi.org/）。 请问怎么办？ 谢谢！ 注：这是该数据库涉及的文献： gkj072.pdf