...######################################################### # 安装STRINGdb 软件包 # source("https://bioconductor.org/biocLite.R") # biocLite("STRINGdb") ############################################################ library(STRINGdb) # 设置程序参数 work_dir <- "/Users/zhangqiuxue/Document...
老师，您好，运行 structure_plot.r -d ./ -s admixture.nosex的时候，提示bash: structure_plot.r: command not found 这是怎么回事呢？ 用的是这个镜像：
利用教程中的pip install RSeQC，出现三处红色显示的错误，试了下pip install其他的也同样报错，不知道是不是什么库没安装； 分别是bx-python、python-lzo；代码如下，找了好几个版本的答案，没能解决 root@iZbp10cjxe9c7ip0m4hzhwZ:/bioapp# pi...
RagTag是一个集合功能的软件可以用来构建scaffold、提升基因组组装质量，其主要功能用法如下： usage: ragtag.py <command> [options] assembly improvement: correct homology-based misassembly correction scaffold h...
我在学习了TCGA基因差异性表达的课程后，想用r包goplot绘图，但是发现有几个值好像在结果中没有，请问这些值怎么在分析中得出来呢？AveExpr t adj.p.Val B这几个值
我的GFF文件是这样的： 运行perl script/mRNAid_to_geneid.pl Arabidopsis_thaliana.TAIR10.41.gff3 mRNA2geneID.txt得到的文件是这样的： 请问怎么处理啊，老师？
老师您好，请问，两组数据每组2个样品，对比差异基因，应该用什么方法？我看说的limma包至少每组要3个样品，不知道2个应该怎么对比
...vated脚本输出的pi值好像是按照染色体上窗口位点的PI值，怎么才能得到一个群体的PI值呢？
...审核的时候也是以这一条标准做为最优先的准则。提问者怎么判断呢？很简单，把自己置于回答者的位子上去审视一下你的问题，看看做为回答者的你是否可以通过这些表述知晓题意。 如果你的问题如下，将不与审核通过： ...
...只有孤零零的叫做“默认”的文件，请问老师，接下来该怎么办？
...都有 且基因位置信息没有错误 所以我想请教一下到底是怎么回事呢？
...行起来输出内容太多，导致红色的报错内容看不到，请问怎么才能只看每次运行的报错内容。 2.之前已经提取了需要的数据放入了“%motifID”，部分结构如下： 'sequence_117' => { ...
老师我在下载TCGA数据时想下载特定部位（primary site）的病例数据，所以加了primary_site <- "Gum"和primary.site = primary_site,但是运行后显示错误 ，我应该怎么改？
老师： 您好！我用TBtools做了一个三连图，但是转录本方面有点显示EXON，有的显示CDS，不统一。尝试把GTF文件中的所有"EXON"替换为"CDS"或"CDS"替换为"EXON"后，却又不显示UTR部分，不知道为什么。。。 请问怎么解决？！谢谢！
... 1. if 语句 这个跟高级语言的 if - else - if 类似，只是格式有些不同而已，也来看个例子吧： #!/bin/bash read VAR # 使用 [] 判断，注意左右加空格 if [ $VAR -eq 10 ] then echo "true" else echo "false" fi #判断是否为文件 if [ -d test.t...