文章 宏病毒组分析一区

...患者（Aβ+ADs）和35名健康对照组（HCs）的肠道病毒组进行分析以鉴定与AD相关的病毒特征。与HCs相比，Aβ+AD患者肠道病毒组的α-多样性降低，表明噬菌体丰富度较低；Aβ+AD患者肠道中的乳球菌噬菌体的Siphoviridae家族显著减少。使...

问题 pip install RSeQC安装时候报错，是不是底层的库不全？怎么解决呢

...安装； 分别是bx-python、python-lzo；代码如下，找了好几个版本的答案，没能解决 root@iZbp10cjxe9c7ip0m4hzhwZ:/bioapp# pip install RseQC Looking in indexes: http://mirrors.cloud.aliyuncs.com/pypi/simple/ Collecting RseQC   Downloading http://mirrors.cloud.aliyuncs.com...

问题 EMMAX进行GWAS分析时候出现问题

#kinship 亲缘关系矩阵计算 ibs-kinship emmax-kin-intel64 -v  -s -d 10  -o ./pop.kinship.IBS  snp_var，在执行这条命令的时候，结果文件中全是IBS中全是-NAM，没有具体的数值。 在上一部用pLINK的时候用的命令是plink --vcf $vcf \      --recode12  --...

问题 老师，我正在做泛基因家族分析的结构变异与基因注释部分，出现一些错误

老师，我正在做泛基因家族分析，结构变异与基因注释部分，#转换gff3到genePred 格式并转换转录本格式至基因ID，尝试了不同的指令，均未能成功修改 sed -i "s/\\.[0-9]*$//" ${ref}_refGene.txt ，之后在excel中完成修改，结果如下：之后...

问题 扩增子16s分析：heatmap plot报错

老师您好，我用自己的数据和您视频提供的数据做heatmap plot都提示如下错误，请问需要怎么解决？谢谢老师！ Error in `.rowNamesDF<-`(x, value = value) :   duplicate 'row.names' are not allowed Calls: rownames<- ... row.names<- -> row.names<-.da...

问题 基因组染色体共线性分析出现 Unable to run 'false OUTFig.gp', Inappropriate ioctl for device

采用/mummer-4.0.0rc1/mummerplot进行共线性分析画图时，出现报错，如何解决？

文章 perl中单引号与双引号区别

...，比如“\t \n”都是代表字符串本身，即单引号内的\n并不是换行符，而是表示字面上的两个字符； 而双引号中的反斜线更为强大，可以转义许多控制字符，双引号中“\t \n”分别代表水平制表符和换行； print 'hello world  \t \...

文章 实验研究中的肿瘤细胞从哪来?肿瘤细胞详解

...准医疗的肿瘤诊治模式。例如将基因筛选与体外肿瘤模型分析相合，可以更大程度上的筛选出对病人个体有效的化疗药物，从而最终实现对患者进行个体化精准用药的目的。 缺点：但是分离比较困难，操作麻烦。 ②肿瘤细胞...

问题 老师，在泛基因家族分析，我提取最长转录本时输出的gff文件是空的，能帮我看一下为什么吗

上面是要分析的gff格式。 上面图是提取最长转录本的指令 上面是指令的日志。

问题 老师，我正在做泛基因家族分析，在构建泛基因列表时，整理完matrix.txt文件，进一步进行矩阵整理时，得到的pangene.txt为什么都是nogene呢，另外，我们老师，我正在做泛基因家族分析，在构建泛基因列表时，整理完matrix.txt文件，进一步进行矩阵整理时，得到的pangene.txt为什么都是nogene呢，另外，我们

老师，我正在做泛基因家族分析，在构建泛基因列表时，整理完matrix.txt文件，进一步进行矩阵整理时，得到的pangene.txt为什么都是nogene呢？ 另外，我们做基因家族存在缺失分析，是用final.last.gene.pair.txt这个表格信息吗？ pangene....

问题 blast2go本地化过程中，导入数据库不全，请问老师是哪一个数据库出了问题？我还想要一份无参GO注释的流程或者手册之类的，谢谢

老师，我按照网上的流程（https://www.plob.org/article/6113.html）进行blast2go本地化，执行以下命令后，我的b2gdb这个文件下并没有作者显示的这么多，请问是哪一个数据库我导入出了问题？有没有无参GO注释的流程或者手册之类的推荐...

问题 想问下用ADMIXTURE进行群体结构分析后，用课程提供代码可视化的时候，一直出现如下图的报错是怎么回事儿?输入文件的P,Q,nosex文件都检查了，没发现哪里的问题，之前其实也做过同样的分析，没有出现问题。这次只是数据量和个体数不同。应该怎么办？谢谢大家。

问题 水稻中进行MCScanX共线性分析基因家族加倍时，提取不了基因对应的蛋白质序列

在课时14. MCScanX共线性分析基因家族加倍过程实操课中，已获得AT.gff文件，用它利用get_fa_by_id.pl来提取对应的蛋白质序列，发现提取不了，然后发现Oryza_sativa.IRGSP-1.0.pep.all.fa与拟南芥的数据库文件形式不同，没有对应的蛋白质ID...

问题 老师，您好！根据您得帖子，我在BinGO分析做GOmaping时还是不能完成，希望可以得到您得指导！十分感谢您！

https://www.omicsclass.com/article/339这是您写的帖子，老师我现在分析得植物是非模式植物，需要自己做一个GO注释，但是文件得格式总是错误。希望得到您得指导，十分感谢您！

问题 meme分析报错：Illegal character `U' in sequence LOC105388627. Change alphabet or fix data file.

请问老师，是根据最终得基因ID提取得蛋白质序列，为什么在做meme分析时，会出现这种错误？