问题 GWAS分析的教程中06.impute的beagle填充出现问题

具体问题提示为：java.lang.IllegalArgumentException: Sample Line68 has an inconsistent number of alleles. The first genotype is diploid, but the genotype at position Chr2:35902177 is haploid

问题 老师您好，我在tassel进行GWAS分析之前的排序报这样的错误，应该怎么解决呀？

这是我的hapmap文件截图

问题 基因组重测序数据分析实战课程中的index.sh运行报错，显示没有对应的pl

各位老师好，我在学习基因组重测序数据分析实战，运行index.sh时，显示没有找到retrieve_seq_from_fasta.pl 这个代码，我去scripts里面找，确实也没有这个retrieve_seq_from_fasta.pl ，怎么办啊?

问题 基因家族分析circos时显示基因基因数目超出最大值怎么办

请问出现如上提示如何解决？会影响最后的图吗？我的基因家族间link文件中的基因未完全在最后的图中显示出来 是受到这个的影响吗

问题 Rstudio进行WGCNA分析时无法输出GS和MM值表格，无法输出cytoscape nodes edges文件

根据WGCNA课程中的代码运行Rstudio程序进行分析时，其他的代码都能正常读取并获得相应的图片，但是不能输出GS和MM值表格和cytoscape nodes edges文件。代码输出结果如图所示。请老师帮忙查看，是什么原因，应该如何修改？十分感...

问题 老师您好，我在用plantcare分析启动子时，提交序列之后报错，具体情况如下图

我看了一下序列里面有出现M、G字母，而其他正常序列出现了几个N字母也可以正常出结果。

问题 分析差异基因时，为什么要用FDR，能直接用p_value吗？

问题 WGCNA分析中模块与性状正负相关性的意思？

比如在下图中brown模块与weight性状成正相关，意思是指brown模块中基因在weight性状中表达量是上调的吗？brown模块与glucose-insulin性状成负相关，意思是指brown模块中基因在这个性状中表达量是下调的吗？ 请老师具体解释一下正负...

问题 MEME网站分析蛋白结果要怎么看motif，查文献看该motif的偏好结合元件

问题 环状RNA分析中，在比对时为什么采用BWA比对方法，而不是采用Bowtie？

问题 在使用bio-linux中的meme分析蛋白保守结构域的时候出现问题。

问题 Linux 生信分析环境搭建可以用苹果的OS系统吗，如果可以最低需要什么配置？

问题 老师，做基因组内共共共线性分析出现这种错误的原因是撒原因？

问题 请问一下要做进化树分析，至少需要多少个家族成员，只有两个是不是不可行？

问题 老师，请问只有gff文件，cds文件和pep文件，该如何做基因上游顺式元件分析