找到约 15 条结果

问题 smooth.value

...的value 和  smooth.value 结果有差别，我想知道smooth.value 是怎么计算出来的？ chrstartendvaluesmooth.value NC_062971.11100000-0.632539336016865-0.430585052618588 NC_062971.150001150000-0.632539336016865-0.433298065264543 NC_062971.11000012000000.621196287833271-0.44235448666...

问题 cafe进行基因家族的扩张和收缩分析

cafe进行基因家族的扩张和收缩分析得到的结果应该怎么看？为什么结果里面统计的 扩张、收缩和保持不变 三者之和不等于 基因家族的总数？

问题 TCGA生存分析课程risk socore问题

请问按照课程中的代码来，要怎么导出示范论文里的这个公式？或者是说找出随便一个基因来根据表达量计算它的风险值？

问题 使用clusterProfiler进行富集时，无法生成图片

使用clusterProfiler对非模式生物进行GO/KEGG富集时，无法生成图片，最后只有一个白框。而且最终结果dim后发现也不正常，有没有大神知道这是怎么回事？ 代码及详情见图片

问题 indel引物设计

... 1.fa文件需要这个物种的全基因组么？ 2。indel的vcf文件怎么获得的？我有一个excel的文件，里面有indel位置、序列啥的。可以直接用这个转换成vcff文件用么？我咋转换不了

问题 安装biolinux虚拟机时，如何开启Virtual technology功能？

想在Windows 下装biolinux，但是总是提示没有开启VT功能，怎么开启呢？

问题 mapman秩和检验表格解读

老师：您好！ 1、怎么理解这个秩和检验的P值？类似我们的p-value值吗，越低显著性越高，是吗？2、Elements这项数据，有的和图中的方块数是相同的，有的值又比方块数少？{方块是20个，Elements是13}，这是为啥？望指教，谢谢！...

问题 学习中遇见的问题

...一直停在一个地方不动了，大概有2个多小时了，不知道怎么回事，跪求解答。

问题 老师好，我有风险模型的问题请教

老师，我用R做的风险得分，但是文章中我给的公式时是 风险系数*表达值，这样就缺了h0t,我想知道怎么求出h0t，麻烦老师给解答一下，谢谢！

问题 如何对已经筛选的区域进行注释呢？

使用bedtools根据ROD对样本进行了筛选区域的基因提取，获得了top5的基因txt文件，文件里大概只有基因的loc号码和位置等信息，并没有注释信息，应该怎么做呢？

问题 bioconductor source代码报错

...oding = encoding) :  InternetOpenUrl failed: '操作超时'。请问怎么解决？ 

问题 TCGA差异分析如何根据临床信息分组？

想请教一下，看课程里面TCGA做差异分析都是根据肿瘤非肿瘤组进行分析的，我想根据病人的临床信息，如是否接受放疗，是否用过某种药物进行分组寻找差异基因，应该怎么做呢？

问题 agilent双通道芯片数据标准化

请问一下老师，为什么根据课程进行芯片数据标准化之后，他的表格数据没有对应上，而且有的数据很大是怎么回事？看了一下您课程里获得的表达数据也是这种情况。希望老师可以帮忙解答

问题 WGCNA邻接矩阵转化成拓扑重叠矩阵时出现异常

请教一下，WGCNA邻接矩阵转化成拓扑重叠矩阵时出现这种报错怎么处理？

问题 重复序列注释的问题

...ker镜像进行重复序列注释中，出现如下错误，请问老师该怎么解决： Reading liftover chains Couldn't open /work/data/genome.chain , No such file or directory 另：在一次全部运行 01.Repeat.sh时，如果中间出现报错，是要重新运行 01.Repeat.sh 吗？能...