找到约 15 条结果

问题 老师，做all_sample_qc时候python: can't open file '/qc_stat.py': [Errno 2] No such file or directory

[root@73d64505fa22  22:26:35 /work/my_rnaseq/2.data_qc]# python $scriptdir/qc_stat.py -d $workdir/2.data_qc/ -o $workdir/2.data_qc/ -p all_sample_qc python: can't open file '/qc_stat.py': [Errno 2] No such file or directory

问题 用 hisat2 建索引时出现 “is not reverse-deterministic, so reverse-determinize...”

...接位点位置信息和外显子位置信息，之后用如下命令： hisat2-build -p 12 --exon ${EXON} --ss ${SPLICE} ${FASTA_File} ${BASE_NAME} 结果如图所示： 最后系统自动kill掉了建索引的进程，请问这该怎么解决？谢谢！

文章 ImportError: pycurl: libcurl link-time ssl backend (nss) is different from compile-time ssl backend (none/other)

重新安装一下： pip install pycurl --compile --no-cache-dir  --ignore-installed

问题 老师您好！用meme分析motif时显示zsh：no such file or directory:/biosoft/meme/meme-v4.12.0/bin/meme。该怎么解决这个问题呢？谢谢

...00 -mod anr -nmotifs 10 -minw 6 -maxw 100命令后显示zsh：no such file or directory:/biosoft/meme/meme-v4.12.0/bin/meme。该怎么解决这个问题呢？谢谢

问题 老师您好，我在做不同物种之间共线性分析的时候，在#绘制共线性图片：准备两个配置文件为输入文件出现如下错误：IOError: [Errno 2] No such file or directory: 'mcscan_layout'

我在做不同物种之间共线性分析的时候，在#绘制共线性图片：准备两个配置文件为输入文件出现如下错误：IOError: [Errno 2] No such file or directory: 'mcscan_layout' 目录下的文件

文章 error while loading shared libraries: libpython3.9.so.1.0: cannot open shared object file: No such file or directory

移植软件后报了上述错误 解决办法 export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:软件下的lib目录

问题 参考基因组建立索引报错，这是什么原因？

...d -genePredExt Oryza_sativa.IRGSP-1.0.61.gtf unknown_refGene.txt RUN CMD: retrieve_seq_from_fasta.pl --format refGene --seqfile Oryza_sativa.IRGSP-1.0.dna.toplevel.fa  unknown_refGene.txt --out unknown_refGeneMrna.fa NOTICE: Reading region file unknown_refGene.txt ... Done with 45973 regions from...

问题 Error in (function (classes, fdef, mtable) : unable to find an inherited method for function ‘bg.correct’ for signature ‘"HTAFeatureSet", "character"’

对GEO数据进行mas5处理时报错。。不知道如何处理？？ Error in (function (classes, fdef, mtable)  :    unable to find an inherited method for function ‘bg.correct’ for signature ‘"HTAFeatureSet", "character"’

问题 您好，我在用qiime2进行扩增子测序分析但是导入数据时会一直出现改错误，请问有什么合适的解决办法吗?

There was a problem importing manifest:   manifest is not a(n) PairedEndFastqManifestPhred33V2 file:   Filepath on line 1 and column "forward-absolute-filepath" could not be found ($PWD/home/qiime2/Public/data/dyj/HS15_1.fq.gz) for sample "HS15".

问题 在运行table_annovar.pl脚本的时候报错

...system command <convert2annovar.pl  -includeinfo -allsample -withfreq -format vcf4 all_sample_INS_DEL.vcf.gz > all_sample_INS_DEL.avinput> NOTICE: Finished reading 6401 lines from VCF file NOTICE: A total of 6371 locus in VCF file passed QC threshold, representing 0 SNPs (0 transitions a...

问题 Can't open perl script "script/get_fa_by_id.pl": No such file or directory 老师请问这是什么原因呢？

我不是很清楚，是直接在share文件夹里新建一个script目录，然后把脚本文件放进去就可以了吗？

文章 ggplot2控制坐标轴截距交点位置（原点）

... is placed some distance away from the axes. The defaults are c(0.05, 0) for continuous variables, and c(0, 0.6)for discrete variables.连续性和离散型都涉及，默认值不同，离散型scale_y_discrete 或者scale_x_discrete，这里针对连续性进行介绍： 参考画图数据和...

文章 win10系统docker 重装提示 Exising installation is up to date 解决方法

出现这个问题是因为卸载Docker没有卸载干净，导致无法重装 解决方法： 按下Window+R唤起命令输入界面，输入regedit 打开注册表编辑在地址栏输入HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Uninstall\Docker Desktop 将整个Docker...

文章 cactus下载

...测使用： source venv-cactus-v2.9.9/bin/activate# 看看能不能找到which cactus# 看看版本编号cactus --version 可以尝试运行作者给出的小示例： cactus ./jobstore ./examples/evolverMammals.txt ./evolverMammals.hal# evolverMammals.hal是产生的结果# ./examples/evolverMa...

文章 libgomp.so.1: version `GOMP_4.5' not found 报错

...seeker包时出现下面报错： Error: package or namespace load failed for ‘ChIPseeker’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...): unable to load shared object '/share/work/biosoft/R/R-v4.2.0/lib64/R/library/data.table/libs/data_table.so':  /share/work/biosoft/lib/libgomp.so.1: version `GO...