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问题 你好老师,我的是win10系统家庭版,我这个docker就是按照给的链接装的,之前按着课程做过一次了,不太熟练,想着从头正在做一次,然后我就把之前的gene-family改了名字,又重新建了一个geng-family跟这个有关系吗,我没有升级

问题 群体遗传课程admixture的问题

用课程测试的数据运行admixture的时候,显示segmentation fault. 因为docker镜像omicsclass/reseq里面没有找到admixture,所以用conda install另外安装了admixture。我用docker其他镜像的admixture,也是不行,还是显示segmentation fault。

文章 组学大讲堂-8月直播课程安排!总有一个适合你!

...课程陆续的补充进来。 课程名称直播时间Fasta序列处理-Docker虚拟机应用8月7日15:00在线绘制维恩图与热图8月11日15:00Mutmap数据分析实操8月14日15:00进化树构建与美化8月18日15:00SRA数据库测序数据下载8月21日15:00文章经典图片之R语言...

问题 关于重复序列注释的问题

...ork/biosoft/RepeatMasker/RepeatMasker/Libraries/RepeatMaskerLib.h5;但我docker获得的镜像genome-assembly:v1.0中/share/work/biosoft/却没有RepeatMasker这个文件夹。请问是否是重复序列数据库未放在docker的镜像中?

问题 搜索不到组学大课堂的镜像

[chenzhaojin@lfpara ~]$ curl -s https://hub.docker.com/v2/repositories/omicsclass/genome-annotation/ [chenzhaojin@lfpara ~]$ docker search omicsclass NAME                                                DESCRIPTION                                     STARS...

问题 加载镜像出问题

docker load -i pop-evol-gwas-v2.0.tar.gz a5ca99798109: Loading layer [==================================================>]  3.072kB/3.072kB open /home/software/docker/overlay2/97f7231d70280dafd0d38fa35f012c1eb35b2f2eec9aa6465adce7b47edfc598/.tmp-committed1222550407: no such file or directory ...

问题 在进行GWAS的LDBlock可视化中,在Win11本地的Docker执行LDBlockShow -Cutline 7 -InVCF $vcf -OutPut LD.p \ -Region Chr1:36000000-37000000 -OutPng -SeleVar 2 -InGWAS ld.pvalue.txt -PointSize 0.8命令时,程序居然报错UnKnow argument -PointSize,请问这是怎么回事呢,如何解决呢?请组学大讲堂的老师麻烦回答一下!谢谢!

问题 下载不了镜像organelle-assembly-v2.0.tar.gz

docker load -i /share/docker_images/organelle-assembly-v2.0.tar.gz,提示没有这个镜像

文章 基因组注释流程,PASA mysql 数据库启动 exited

最近有学员反映mysq启动之后exited: 查看log: $ docker logs 49b994b23f23 2023-03-21 09:38:40+00:00 [Note] [Entrypoint]: Entrypoint script for MySQL Server 5.7.41-1.el7 started.2023-03-21 09:38:40+00:00 [ERROR] [Entrypoint]: mysqld failed while attempting to check configcommand ...

问题 New state of 'nil' is invalid

...基因家族分析的视频学习中,设置好所有步骤并成功安装Docker Desktop后,根据老师的教程输入命令进入虚拟机时一直报这个“New state of 'nil' is invalid”。尝试卸载Docker Desktop后重启电脑重新安装还是这样。这种情况应该怎么办呢?

问题 老师您好,请问我mac电脑如何启动镜像

docker run -it -m 3G --cpus 1 --rm -v D:/ampliseq-q1:/work omicsclass/ampliseq-docker run -it -m 3G --cpus 1 --rm -v D:/ampliseq-q1:/work omicsclass/ampliseq-q1:v1.2 这是您的代码。我的存放的文件地址是/Users/wuzhengyuan/Desktop/1/qiime1

问题 老师,我更换镜像了,但本地镜像一直加载不了,显示如下。然后,我在服务器上,导入镜像,运行docker run -it --rm --name pangene --group-add keep-groups -v /home/us132/pangene:/work localhost/omicsclass/pan-gene-family:v2.0做了泛基因集构建。之后继续做其他分析,然而,运行镜像时一直出错,进不去,错误显示如下。

本地镜像导入:系统运行时

文章 bugbase指定表型预测

...。 准备好文件之后,运行代码即可。 运行代码 1. 打开DOCKER虚拟机,进入镜像(注意:运行成功需要至少25G的内存,所以需要给docker更多的内存) docker run --rm -m 25 -v D:\project\bugbase:/work -it omicsclass/ampliseq-q1:v1.2 2.生成指定表...

文章 16S多样性分析docker镜像发布及使用

...,这里我们组学大讲堂发布了专门用于微生物扩增子分析docker镜像,里面内置了几乎所有要用到的关于多样性分析的相关软件,方便大家使用,只需安装docker并下载该镜像即可,避免繁琐的软件安装问题; 扩增子分析流程介绍 ...

文章 linux系统使用-初学Linux推荐课程

...约学习成本。 识别以下二维码直达课程: 如果安装过docker,可不用安装vbox的bioLinux; docker的学习链接:https://zzw.xet.tech/s/3Rcvt0   延伸阅读 R语言基础绘图 | R语言快速入门与提高 | 学基因家族分析 |  基因家族分析...