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问题 你好,我想问一下,为什么分染色体提取的序列有的能全部提取,有的只能提取一条?谢谢!老师您好,您看看这个输入文件,是不是有问题?谢谢

文章 annovar的染色体识别问题

...要尽量把染色体改成数字的形式,如果是NCBI的数据,可以查询NC编号对应的数字:

文章 MAFFT介绍

... 常见命令 基本比对命令:mafft input.fasta > output.fasta这个命令会对input.fasta文件中的序列进行比对,并将比对结果输出output.fasta文件中。自动选择比对策略:mafft --auto input.fasta > output.fasta使用--auto选项,MAFFT会根据输入...

文章 Mapchart 添加标尺

Mapchart  可以用来绘制基因染色体位置图 (https://www.omicsclass.com/article/397),图片中可以直接显示基因位置数据,此外还可以转换成标尺的形式显示位置: 设置初始图片后,选择Tools-->Chart options-->Loci -->Positions设置成 Ruler...

文章 docker虚拟化技术及其在生物信息数据分析中的应用(linux)

...使用方法 5.1 运行一个 container并加载镜像centos运行起来这个实例后,在实例中执行 /bin/bash命令[root@omisclass ~]# docker images    #查看镜像 等于命令 docker image lsREPOSITORY          TAG                 IMAGE ID            CREATED    ...

文章 项目管理工具,选择本地部署还是上云?

...都被买断,购买本地安装的企业,如果不考虑成本,完全可以根据自己的需求进行私人定制,自主性较高。 三、云服务的优点 ①部署成本较低:云服务部署,因为不用购买服务器,不用请运维人员,整体价格会比本地安装...

文章 生物汪看《疯狂的外星人》,心真累!

...这样一个在测序行业摸爬滚打数年的“资深人士”,感觉这个“基因球”本身并不符合外星人神级科技文明的身份,据我分析电影中的这颗“基因球”仅仅兼具了样本的采集和存储能力,获取人类基因组信息似乎还需要外星人回...

文章 组学大讲堂教程优惠信息

...返回课程页面点击领券购课按钮,满减或其他优惠结算时可以使用。组学大讲堂网课首页电脑端链接: https://study.omicsclass.com 组学大讲堂课程目录: 购买过程中如遇问题可以联系微信“532812110”咨询。

问题 基因家族分析时搜索两个没有组装染色体水平的基因,请问可以删除这两个基因吗

问题 请问老师,基因家族里面筛选很多对重复基因,那么kaks计算只能一对一对进行吗?准备文件要一对一对分开准备吗?我把所有重复基因的序列号全部沾dupid里面是不是不行的?上课的例子只筛选了一对WRKY基因。谢谢解答。

文章 组学大讲堂视频课程

...成本的下降,让它成为了很多课题组常用的实验手段,在可以预见的将来,其还会占据越来越重要的角色。这时候一个熟练掌握生信分析技能的人,必将在实验室发挥巨大的作用,成为课题组的科研之星。然而,生物信息学是一...

文章 IF=6.68| HCC肝癌单细胞数据挖掘实践

...,得4个cluster,其中cluster 0是最初始细胞亚类,发现PGLS这个基因在cluster 0中高表达。通过TCGA中的数据,发现这个基因高表达与病人的预后差相关。在后续的湿实验中,作者重点验证了这个基因(通过激活戊糖磷酸途径促进肝...

文章 在线进化树美化网站-iTQL

...分钟做一张让人羡慕的系统进化树图!有不少在线工具可以实现这项工作,譬如iTQL:http://itol.embl.de/ 进入网站主页之后,选择Upload进入数据上传页面,提交MEGA构建进化树的结果文件nwk. 导入文件nwk,或者直接粘贴nwk文件中...

问题 单细胞转录组分析实操课程Double Finder双细胞查找运行显示43%killed,用咱们上一部得demo中的.rds数据运行是不行

文章 论文作者署名:导师和学生之间的一场大战

...作者排序又和我们的奖学金,毕业等息息相关, 所以,这个时候,论文的一作署名,才显得那么的重要。 有一个调查,在 364 名来自各个国家的调查对象中,有三分之二的人表示他们在论文署名过程中上受了来自上级学者的...