问题 请问在做SSR分析用circos,会显示配置文件报错要怎么解决呢，完全粘贴课程内容中的conf配置文件

问题 老师好，我在做gwas分析小麦时，按照脚本进行vcftools 过滤生成clean.vcf.gz 文件后出现以下问题，该如何解决

问题 基因家族大概四十个基因，GO富集分析只有CC组数据正常吗？阈值调到0.1也依旧只有CC组

问题 关于TCGA的下载，学了课程还是遇到点问题，求老师指点

...代码也没问题。但是自己实操中，遇到情况就有点复杂，不会用了。 我是要结肠癌和直肠癌，并且要腺癌的样本数据，有点复杂，这是我网页筛选条件，代码不知道怎么写。 看了论坛里老师筛选原发位点的帖子 我想先根...

文章 让AI帮你处理数据，绘制图表！让你强到可怕！

...优惠仅需0.99元），课程围绕 AI等人工智能在多组学数据分析中的强大应用展开，帮你轻松搞定多个重要的组学数据分析及绘图可视化！仅需说话就能处理数据，绘制图表！ ✅  课程亮点 介绍AI基本原理及其在生物信息学中的...

问题 老师您好，我在做mcscanx共线性分析基因家族加倍实操课程时，安装mcscanx报错

根据咱们已经回答的问题，把报错make: *** [mcscanx] Error 1，进行了修改，只需要给MCScanX 目录下的 msa.h, dissect_multiple_alignment.h, and detect_collinear_tandem_arrays.h 这三个文件内容 最前面添加#include <unistd.h>。 但是又出现了另一种报...

问题 老师您好，在KAKS分析时duplication_gene.out导出为空怎么解决呢？

在运行perl ../script/KAKS_SHAIXUAN.pl -in1 JmjC_cds_confirmed.fa.fai -in2 JmjC_cds_confirmed_blast.out -out duplication_gene.out这一步后结果为空，但中途也没有报错。 以下是生成的文件，还想麻烦老师看看是什么问题。

问题 有参转录组分析

Delimiter: "\t" chr (19): #query, seed_ortholog, eggNOG_OGs, max_annot_lvl, COG_category, De... dbl  (2): evalue, score ℹ Use `spec()` to retrieve the full column specification for this data. ℹ Specify the column types or set `show_col_types = FALSE` to quiet this message. Error in file(...

问题 老师您好，进行比较基因组分析时候，单拷贝直系同源群为0，后续的分析就出现了报错，这是什么原因，是我选择的基因组不合适还是其他原因。

2025-08-08 15:00:35 Running OrthoFinder algorithm 2025-08-08 15:00:35 ----------------------------- 2025-08-08 15:00:39 2025-08-08 15:00:39 : Initial processing of each species 2025-08-08 15:00:52 2025-08-08 15:00:52 : Initial processing of species 0 complete 2025-08-08 15:00:55 2025-08-08 15:00...

问题 提取基因在染色体位置时发现gff3文件中的染色体编号不好理解。疑惑。

老师，我的基因组注释文件gff3中，染色体编号不一样，1-9就是阿拉伯数字，10-33的反而是bd_数字1×数字2。我不懂数字1和数字2各自代表什么意思？猜测数字1代表染色体编号。是这样的吗？但是数字2又不知何意了。 另外，提...

问题 lncRNA分析结果中，和参考基因组的比对效率比较低，那么我在发文章过程中，审稿人会有异议么？

问题 基因家族分析预测顺势原件时，得到的Ptomoter文件中原来43个基因只有29个显示启动子序列，其余19个无序列信息

问题 你好，腾讯云服务器里面的学生购买的的那个，可以用来进行重测序数据的比对以及SNPcalling等的数据分析吗

问题 老师您好，我在做基因结构分析时，只得到mRNA和CDS的信息，请问这个脚本该怎么修改才能得到exon的信息呢

问题 RNA-seq分析，用index.sh建立索引exons.tsv文件为空

用index.sh脚本，根据全基因组的.fa文件、gff文建立索引时，生成的exons.tsv文件为空，splicesites.tsv为空。报错说没有gene_id，gtf文件是由gff生成，是因为gtf文件里缺失gene_id吗？那该怎么整理补齐呢？请老师指点，谢谢老师~ 报错如...