...格式的氨基酸序列，还是直接将氨基酸序列拷贝到gblocks中，都报错，页面如图，烦请您帮我分析下问题所在。多谢老师不吝赐教！另还想请问您，gblocks中有两个options选项，这个在选择时有没有什么依据？
...详解如下： 更多linux操作基础可观看：《linux系统使用视频课程》 我们组学大讲堂不再支持vbox中的biolinux，转向用更好的虚拟机工具Docker，学习安装使用课程见： https://zzw.xet.tech/s/3Rcvt0 更多生物信息课程： 1. 文...
您好，电脑是联想Thinkbook，W11系统，未进行任何操作前电脑显示虚拟化已开启，但是我后续勾选hyper-V，开始过程中一直失败，为什么呀？
报错 在利用GATK进行markdup和variant calling的时候出现报错： 报错的主要信息用红框框出了，错误信息是：错误为发生JNI错误，请检查安装并重试。 出现报错的原因： 1. javac与java版本不同所致，可以采用以下方法进行检查。...
我在linux系统中进行操作的时候出现了以下情况 然后导致我所得到的结果只有一条 我所用到的mrna_location.txt文件如下 还有物种染色体基因组文件如下 所有染色体都有 且基因位置信息没有错误 所以我想请教一下到底是...
...画共线性图的时候，调试layout文件，发现没有办法把文件中的y那列扩大，好像只能是0-9之间的一位数数字，不能写两位数数字，但是我比较的物种有七个，画的图感觉特别拥挤， 不知道老师有没有什么好办法能扩大一下整张图...
...最新版本的linux 64位安装包。 右键复制链接地址，在linux中使用wget 命令下载。 wget http://www.clustal.org/download/current/clustalw-2.1-linux-x86_64-libcppstatic.tar.gztar -zxvf clustalw-2.1-linux-x86_64-libcppstatic.tar.gz 解压目录下的命令就可以直接...
给大家介绍一个R包用于绘制Cladogram，直接附上代码： if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) { install.packages("BiocManager") } BiocManager::install("microbiomeMarker") library(microbiomeMarker) library(ggplot2) #方便起见，直接使用该包自...
...A（格式）, 如果可以让它们前后交换也可以，这样就可以用mRNA提取了 相关脚本.rar（geneid_to_mRNAid.pl为原脚本，另外两个为修改后运行不成功的脚本）
TxDb 包是用 GenomicFeatures 包构建的，用于专门注释基因组中转录本、外显子、内含子等的包。 如果是构建从 Ensembl 下载的参考基因组的 TxDb （transcript database）包，有两种构建方式，一种是直接利用 biomaRt 包构建，另一种是利用 ....
...应关系时遇到一个问题。由于根据结构域预测导出的结果中给的是mRNA的Name,而不是ID，因此无法参照您给的命令得到想要的结果，但又不知如何操作，望指点，谢谢~ 第一行为gene，第二行为mRNA，文件为基因组的gff文件。 下图...
老师： 您好！我用TBtools做了一个三连图，但是转录本方面有点显示EXON，有的显示CDS，不统一。尝试把GTF文件中的所有"EXON"替换为"CDS"或"CDS"替换为"EXON"后，却又不显示UTR部分，不知道为什么。。。 请问怎么解决？！谢谢！
trait文件的准备，比如可以使用0、1的分类数据来分类发育时期，同时使用关注单个基因的表达量来作为数量数据吗？ 两种数据类型是否可以出现在同一trait文件中？
...果没有安装成功 环境变量的设置 #安装相应的包 在cmd中输入pip install numpy #此处以numpy为例 #注：如有错误，请联系我yangj9932@gmail.com
...章，另外我在github 上也看了isoseq3的流程，发现您的文章中没有isoseq3 refine 这个步骤。不过虽然github上有这个步骤，但是isoseq3 中并没有refine 这个工具（我是通过conda install -c bioconda isoseq3 这个指令来安装的）。这个感觉是官方的...