老师，你好./ParaAT.pl -h WRKY1.pairid -n WRKY1.cds -a WRKY1.pep -p proc -o output -m muscle -f axt; 执行这条命令时报错了如果我把 -m muscle去掉就不报错了，-m这个参数好像又不能去掉吧，应该怎么解决呀？
求大神
2019年注定是学术圈“动荡” 的一年， 由年初的“不知知网”的翟博士起头， 依次拉开来了我国学术风气整治的大幕： 各大高校严把毕业论文质量大关还不算，还清除退学了一大波不合格的研究生， 年中才曝出中国工程院...
转录组数据分析时，进行到read 与基因组比对时，产生的sam文件为空，summary文件信息为： Error reading _rstarts[] array: 1010748, 1017096Error: Encountered internal HISAT2 exception (#1)Command: /biosoft/hisat2-2.1.0/hisat2-align-s --wrapper basic-0 -p 1...
回归分析中R2指的是结果变量（y）的观测值与y的拟合（即预测）值之间的相关系数；因此，R的值将始终为正，范围为0至1。 相关系数R2：表示你的曲线线性是否很好，理想状态是1，但是达不到。一般应该在0.99以上。越接近1，...
小白想用MeV软件进行K-Mean clustering分析。请问大家有没有详细的软件使用教程发我一份？（中文版图文最好）。目前有以下两个问题： 1.怎样准备数据文件？例如，需要分析不同时间点的样品中基因，将表达模式相同的基因聚类...
您好.doc
老师好！想问下群体结构分析时，Rscript /work/my_pop_cucu/scripts/structure_plot.r -d ./ -s 137filtered.snp.pruned.nosex -f 137pop_group.txt -g Group，报错：WARNING: ignoring environment value of R_HOME --> Q&A for bioinformatics, please visit the website: https://www.om...
红色框中是两个基因并列在的一起，导致后续的分析没办法继续 这样的文件一共有600多个，所以希望老师能给我一个代码进行统一的整理，谢谢
这是什么原因啊 实在是找不到原因，希望老师帮忙解答
NCK_vs_NM_vs_TM.txt all_gene_fpkm.tsv all_gene_count.tsv
manager@bl8vbox[yu] /biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.graphics.karyotype --format=pdf --figsize=15x15 ph_seqid ph_layout06:27:19 [base] Load file `ph_layout`06:27:19 [base] Load file `PH.bed`06:27:20 [base] Load file `PY.bed`Traceback (most recent call last): File "/biosoft/minicond...
cellphoneDB是目前使用较为广泛的细胞通讯分析软件，包含配体、受体及其相互作用的数据库，可以对细胞间的通讯分子进行全面、系统的分析，以及研究不同细胞类型之间的相互交流及通讯网络。 数据库链接：https://www.cellphonedb...
这个是需要拼接吗
# -g为该物种繁殖一代的时间，比如人的默认为25年，该处值为-g 25 我做的是昆虫，一年可以繁殖3代，此时这个参数应如何设置呢？是0.3吗？