老师,请问我在进行疾病与正常对照的微生态群落分析,在环境因子中无法设置连续变量值,是否可填入0、1进行分组分析呢?或者应该如何进行这类的网络分析?
老师好,为什么WRKY_gene_fpkm.xls 和PAV_gene.list都存才Mba这个基因组,但是这个命令执行后,生成的WRKY_gene_fpkm.filter.xls中,其他基因组都有,就没有Mba基因组?
用这个命令跑run_pipeline.pl -Xmx30G -fork1 -h /mnt/data/lj/tassel1/hapmap.hmp.txt -fork2 importGuess /mnt/data/lj/tassel1/trit.txt -combine3 -input1 -input2 -intersect -FixedEffectLMPlugin -endPlugin -export hd_GLM报错说我的importGuess开始不是with dash? dash到底是个啥东西...
snpEFF生成的.txt文件中每一列的标题下这些数值代表什么意义呢?是概率吗?求指教
老师您好!我每次进行下图1中物种分类树图时,出现了以下报错,回查了level_tree_sample.py脚本,发现报错出现在第98行(见图2),这行代码我理解的意思应该是从左往右以K_细菌到右依次检索,按类别分组,我回查了文件“5.pic...
老师您好!我想问下单细胞测序数据如何将rds文件和pbmc.metadata.tsv文件中的某列信息给替换成其它信息?麻烦老师解答,谢谢
...Rrf7mm6iAQZyonIYAFi7RBHSn 课程更新详情 叶绿体基因组分析中,高质量的组装和准确的注释是后续所有分析例如比较基因组分析、系统发育分析、分子标记设计等的基础。 但在组装和注释时存在很多难点和易错点,如下所示: ...
老师您好,我下载的geo数据库中的基因探针都是MSTRG开头的,有没有不用r包就能基因注释的方法,而且我在illumin的官网也没找见注释文件
这篇文章中的第4步进入虚拟器始终不能成功,可以教学么?
比如图片中的随便一个模块
...结构域序列的信息 老师您好,我在分析基因结构的过程中,发现自己总是无法分析得到结构,所得的基因结构gff文件总是空的,也就是0KB,以上是我分析要用的两个文件内部截图,请问我分析不出来的原因会是什么呢,麻烦老师...
...原始数据的时候,打开发现有的gene表达量,在一个对照中,正常组高表达,而肿瘤组中无表达,这样的数据怎么进行FC的计算。能否采取给这些零值赋予极低的表达量,还是单纯的删除这些无法得出FC值,因为注意到有p值出现
...堂制作的《基因家族分析》视频教程,涵盖了该类型文章中绝大部分的分析内容,并尽量照顾0生信基础同学,降低了上手难度,完全可以在个人电脑进行学习和分析,一般经过半个月的学习和练习之后就可以掌握基因家族的分...
...库NCBI上下载数据。 1. 直接下载:数据量小于5G的时候适用 ① 检索:搜索一个sra号,进入RUN的详情页 ② 下载到本地:选择download一栏会直接下载到本地,不想下载到本地请看③ ③下载到服务器:复制下载链接到linux上下载 ...