...的文件走一遍流程,很顺利。 但是换成我自己的就运行不出来了,我有几个小问题,实在不太清楚,麻烦老师帮我解答: 1.fa文件需要这个物种的全基因组么? 2。indel的vcf文件怎么获得的?我有一个excel的文件,里面有indel位...
...,所以就叫做R语言,R是一个功能强大、用途广泛的统计分析、绘图的语言和操作环境。 R语言是生信统计和绘图的首选 为生物统计而生的语言生物数据分析当中很多地方都需要用到统计分析,R的开发最初就是要解决生物统计方...
老师,您好,这是我运行的结果,我检查了运行的过程,发现过程中就没有tandem文件 这是得到的collinearity文件,缺少比对结果 所以想问一下,这是我运行错误还是就是没有共线性? 注:已检查gff文件和Blast文件里的基因名,...
老师您好,我投稿了一篇泛基因家族分析的文章。审稿人问了关于perl的问题。“Please provide the Perl packages or software modules used in the analyses.” 下面是我手稿中写的关于perl的内容: 1.在Linux操作系统中应用本地perl语言分析15个苹果...
...eme命令,设置请见图片,命令运行后就一直停在一个地方不动了,大概有2个多小时了,不知道怎么回事,跪求解答。
可不可以将kaks_greater_than_1_gene_rate.txt中,比值为0.0的WRKY成员删除,然后绘制热图
我在学习老师的基因家族分析时,使用代码进行复制文件时总是报错找不到文件!!!!!
医学癌症TCGA-生存分析课程中基因表达数据处理时通过cmp对表达数据进行标准化处理 我分析的是mRNA的数据 运行下面代码,得到的数据如下图 norExpr <- DGEList(counts=datExpr)norExpr <- calcNormFactors(norExpr) 运行下面的代码后,得...
... mirdeep_runs/run_04_09_2023_t_17_09_26/tmp/precursors.str 原因可能是版本更新,参数有改动。将--noPS参数改为-noPS之后就可以正常输出文件了。
按照教程一步一步来的,文件名也是正常设置,是因为我的用户名是中文吗
不能做串联重复的话,做大片段重复和共线性分析可以吗?还是Un序列上的基因只能以同源基因来说明,谢谢老师
基因家族分析的文章被审稿人提问一基因一蛋白,为什么最大的蛋白对应的不是最长的基因,如果存在可变剪接是怎么确定这个长度的? 我个人觉得是存在可变剪切
...非常直观简单。当我们需要直接合并2个矩阵或数据框,不需要指定任何公共索引时,可以采用cbind函数下图是cbind的用法: 2.rbind 下图是rbind用法: 两个数据集的变量必须相同,顺序可以不一致。合并后,结果会按照第一个...