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文章 R语言基础入门—矩阵介绍

...阵创建 R 语言的矩阵可以使用 matrix() 函数来创建，语法格式如下： matrix(data = NA, nrow = 1, ncol = 1, byrow = FALSE,dimnames = NULL) 参数说明： data 向量，矩阵的数据nrow 行数ncol 列数byrow 逻辑值，为 FALSE 按列排列，为 TRUE ...

问题 GO富集分析

请问一下在做GO富集分析的时候，标记的这里的gene ID怎么才能显示用于分析的gene ID啊，这样我才能知道那些基因对应那个GO term啊，谢谢！

问题 参数设置

1.图中的-L参数，如果有20条染色体，就需要设置为-L1 -L2...-L20吗 2.qeseq脚本中的-t 线程数和-Xmx内存数如何设置能最大利用资源，例如在超算上选择48核心有336G内存，怎么设置好呢？

问题 Plink可以计算IBD吗？

Plink计算IBD的方法是什么？具体怎么操作呀？

问题 基因家族分析

你好，我想问一下，我看文章的基因家族分析都是以蛋白的保守结构域来命名的，就是我做一类基因家族，但是它的保守结构域跟蛋白家族命名不一致，写文章的时候怎么来写这个名字

问题 建树boot是0

老师您看我这个建树的boot值怎么都是0呀？是我哪里做错了吗 还是 mega的参数设置的问题？ 参数设置是：

问题 python版本mcscan出错

我在运行python -m jcvi.graphics.karyotype seqids layout时报错，不知道该怎么解决

问题 保守结构域进化树

老师，用保守结构域构建的进化树，加上motif分析和基因结构后，发现相似的结构域没有聚在一起，这个正常吗?该怎么解释呢？

问题 建立进化树

建树的时候会有很多支持值为0的分支，这个应该怎么处理数据呢？ 而且我怀疑这个出现的原因是我删除了gap的原因，一开始没删除gap的数据无法建树，然后我就删除了全部gap。

问题 重测序

我在重测序call  SNP 的时候，为什么跑一段时间这个镜像就找不到了？但是任务和文件怎么还在更新？ [us001@omicsclass-a06  16:17:00 ~]$docker ps CONTAINER ID  IMAGE       COMMAND     CREATED     STATUS      PORTS       NAMES

问题 braker注释结果有问题

braker.gff3文件中第三列未出现gene、mRNA等层级这个问题该怎么解决

文章 Docker会限制线程数吗

再用hifiasm组装基因组时，线程数选择的100，但是后台只看见了10，这是怎么回事？docker会限制线程数吗？

问题 进化树序列名称如何更改

请问我现在做的进化树序列名称“ 29767.m000208” 是什么意思呢？如果想改成下图的名称应该怎么操作？

问题 泛基因家族分析进化树构建

拟南芥的ID号怎么转化成1/2/3/4的那种形式？

问题 treemix

在用Rscript script/treemix.r -i treemix -o ./ -e 1 -r pop.order.txt 命令绘制图的时候，这些图中图例有的重叠在一起了，怎么修改一下脚本，让Migration weigh 图例 往左移动一下，10 s.e 这个图例 往下移动一下，名称都显示全。