问题 老师，麻烦问一下，共线性分析作图时遇到这个问题是什么意思？

问题 老师，只有FPKM的话，能用什么R包做差异分析啊？

问题 做物种间共线性分析报错，请问哪位大神可以指点一下

问题 物种基因组只有scaffold水平，可以做染色体分析吗

问题 DESeq2 差异分析 FDR 矫正后有很多 NA

问题 比较基因组分析的seqid和layout文件应该如何配置

问题 在做多物种共线性分析是出现输出空文件是什么情况

问题 我现在的数据格式，怎么进行GO和KEGG富集分析呢？

问题 请问单倍型分析时遇到这个报错应该怎么解决

问题 泛基因家族分析-SV和表达量

老师您好，请问这个图的绘制信息在哪个文件，是06中的All.final.sv？下面的HP301就是对应的SUPP_VEC中的显示为1品系基因组吧。变异类型咋看是插入还是缺失呢？长度是两者之差？

问题 有没有GWAS做之前的表型数据一致性分析教程

问题 GWAS分析后选择关联区域（基因）

根据p值获取关联区域中，为什么要用如下语句以合并P值 cat pvalue.bed  region.bed |sort -k1,1 -k2,2n >all.region.bed 合并P值在获取关联区域的作用是什么，可否像之前录像讲的那样不用这个语句吗？

问题 请问各位老师，WGCNA分析中没有性状数据，但分析了两份基因表达数据，我想要得到Module-module relationships的图，应该怎样修改这部分打的代码呢？

#############################relate modules to external clinical triats###################################### # Define numbers of genes and samples nGenes = ncol(datExpr0) nSamples = nrow(datExpr0) moduleTraitCor = cor(MEs, datTraits, use = "p") moduleTraitPvalue = corPvalueStudent(moduleTrai...

问题 猪单细胞测序数据拟时序分析时已知细胞分化起源，怎么修改代码？

猪单细胞测序数据进行轨迹分析时，已经知道分化的起源，想请教老师这个代码应该怎么修改？Rscript $scripts/cell_trajectory_monocle2.r -g mycelltype \   -i subset.T.rds -p monocle2 \   --order.gene.select.method monocle  --heatmap.gene 20 \   --heatmap.clust...

文章 转录组必备说明书！

...安排的学生没接接触过转录组，别说写文章，连公司给的分析结果都看不懂！几万块钱的实验费白白打了水漂。 转录组要是有“说明书”就好了 其实吧，这事也不能怪同学们，毕竟初次接触哪能短时间就懂了呢？ 有过类似经...