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问题 GWAS分析时，基于不同模型分析结果P值计算的膨胀系数相差很大，请问这是什么原因导致，该如何解决。

您好，我在做GWAS分析的时候，使用了MLM、FarmCPU和Blink三种模型，从QQ-plot图看，MLM拟合较好且膨胀系数为1.02，但FarmCPU和Blink都出现了较早的上偏，膨胀系数都大于1.2。我已经将PCA前5个主成分作为协变量进行群体结构校正了，请...

问题 请问下jupyter notebook运行一个不到5M(20万行左右)的文件，内存持续飙升，随后浏览器闪退该怎么解决？

您好！我在学习练习python基础课程时，用jupyter notebook 读取一个不到5M，大概为20万行的文件，运行后浏览器内存占用持续飙升，整个电脑的内存占用由原来的20%飙升到80%以上，浏览器闪退，运行终止，图中所示为运行的程序界面...

文章 blastall 搜索比对输出结果 m8或者m9格式说明（blast+ m6格式）

...haliana.TAIR10.pep.all.fa -d HSP20_NCBI_pep.fasta -p blastp -e 1e-10 -b 1 -v 1 -m 8 -o ncbi_hsp20.out 输出结果表格如下： Query id  Subject id  % identity  alignment length  mismatches  gap openings  q. start  q. end  s. start  s. end  e-value  bit score ...

问题 位点注释老师出错，跑不出想要的VCF+txt文件,使用annotate_variation.pl不会报错

以下是我做位点注释的annotated_variants.refGene.exonic_variant_function.orig文件内容：line3523389 nonsynonymous SNV Os10g0100200:Os10t0100200-01:exon1:c.G87C:p.W29C chr10 44989 44989 G C . . .，但是总是报错：NOTICE: Running with system command <coding_change.pl  /...

问题 TCGA生存分析课程risk socore问题

请问按照课程中的代码来，要怎么导出示范论文里的这个公式？或者是说找出随便一个基因来根据表达量计算它的风险值？

文章 串联重复基因 tandem和segmental的区别与联系

...事件，一次性增加一个物种所有基因的剂量，导致基因组中保留着大量染色体倍增的片段。全基因组复制造成的重复区通常是一大片区域中所有基因的重复，而不是单个基因或几个基因的重复。高等植物，很多都经历过多倍化过...

问题 TFBS文件没有包含所有的转录因子

老师好，组学大讲堂TCGA转录因子调控 一节中，附件中TFBS文件并没有包含所有的转录因子信息，一些转录因子比如FOXD1并没有包含在内，请问可否提供全面信息的附件？谢谢

问题 老师好，我有风险模型的问题请教

老师，我用R做的风险得分，但是文章中我给的公式时是 风险系数*表达值，这样就缺了h0t,我想知道怎么求出h0t，麻烦老师给解答一下，谢谢！

问题 蛋白3D结构预测

...载完了，文件名是model_01。我咋下载模版啊？我根据课件中的公式align model_011, pdb6ir8, cycles=0, transform=0   调整为 align model_01, 7exf.1.A, cycles=0, transform=0 报错。

问题 蛋白3D结构预测

...载完了，文件名是model_01。我咋下载模版啊？我根据课件中的公式align model_011, pdb6ir8, cycles=0, transform=0   调整为 align model_01, 7exf.1.A, cycles=0, transform=0 报错。

文章 singularity运行fastqc报错OutOfMemoryError

比如在singularity中运行： singularity exec /share/singularity_images/reseq_v1.2.sif fastqc $datadir/*.gz  -o $workdir/1.fastqc 可能报错： 可以加一个-t选项，多线程运行，如下图，指定一下线程，可以在自己服务器允许的情况下，多指定几个线程。...

文章 ggplot包中geom_histogram()报错

再使用geom_histogram绘制频率分布直方图时遇到以下报错： 开始以为R包更新导致报错，后来检查发现输入文件有问题。 报错原因为输入文件中掺杂字符串，导致输入数据格式有问题。

文章 素材需求：两个提供精美生物插图的网站推荐！

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文章 Mfuzz做时间聚类分析

Mfuzz 是 R 语言中的一个用于聚类分析的包，专为时间序列或条件数据的基因表达分析而设计。它广泛应用于生物信息学和基因组学研究中，尤其适用于处理具有时间序列的数据集，比如基因表达时间序列。 Mfuzz 使用模糊 C均值...

文章 论文“挑错”哪家强?中国学者64字diss柳叶刀论文，过于霸气!

...哈，其实这句话还可以这样说： 如果你发现别人的论文中有错误怎么办? ——那就写篇论文diss他/她! 或许，还能因此登上顶级期刊哦~ 中国学者64字diss柳叶刀某论文，过于霸气! 事情是这样的： 柳叶刀期刊上有一篇论文， ...