问题 在进行转录组分析时，在自己的服务器上怎么使用以下命令，请老师帮忙解答；（没有root权限，docker镜像用不了，想在外部自己的服务器中使用）

agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl；agat_sp_keep_longest_isoform.pl

问题 ls ../data/*.fa. |sed -e "s/.fa.//g" -e "s#../data/##g" > ../id.txt执行这条命令的时候，未能得到id.txt文件；2.想问一下：每次关掉putty的时候，都需要重新dockers run进入吗？3.软连接之后发现01.data prepare里面有玉米的数据了如何删除此01.data prepare？4.现在发现需要上传id.txt文件，将11个样本名输到txt文件里面，通过filezilla上传到data，再进行docker run？

问题 《微生物宏基因组分析实操》课程，配制分析环境（doc.sh）遇到Bug

我根据视频，输入“. doc.sh”，发现报错，让我选择docker镜像版本，但其中只有docker.io/omicsclass/metagenomics:v1.0镜像可用。我用Rstudio和组学大讲堂提供的服务器分别下载这个镜像（docker pull docker.io/omicsclass/metagenomics:v1.0），但是下...

问题 docker-GSDS网站出错：Request-URI Too Long The requested URL's length exceeds the capacity limit for this server.

Request-URI Too Long The requested URL's length exceeds the capacity limit for this server.

问题 下载你们的GWAS镜像后，在运行时总卡住，等待一段时间后就报错了，是因为这个镜像没有下载好或者安装正确吗，docker images也可以看到v1.2的版本

问题 要进行单倍型分析，但是镜像不是搭建在2.0版本了，docker pull下载不了，联系客服拿到安装包之后一直报错，解决了一天了也没解决问题，求解求帮助

问题 是没有gene-family了嘛

PS C:\Users\Administrator> docker pull omicsclass/gene-family:v1.0.1 What's next:     View a summary of image vulnerabilities and recommendations → docker scout quickview omicsclass/gene-family:v1.0.1 Error response from daemon: pull access denied for omicsclass/gene-family, repository d...

文章 win10装docker desktop提示Installation failed: Containers Windows Feature is not available

在装docker的过程中如有以下报错 解决方法：新建containers.cmd，编辑内容如下，以管理员身份运行，执行完后按照提示重启电脑 pushd "%~dp0"dir /b %SystemRoot%\servicing\Packages\*containers*.mum >containers.txtfor /f %%i in ('findstr /i . con...

问题 在docker中用cleandata与宿主序列比对得到sam文件这一步出现错误，

输入的命令是for i in `tail -n+2 $datafile/metadata.txt|cut -f1`;do bowtie2 --threads 6 \ -x $host_index/Canis_lupus/wolf \ -1 $workdir/1.host_del_and_qc/cleandata/${i}_1.fastq \ -2 $workdir/1.host_del_and_qc/cleandata/${i}_2.fastq \ -S $workdir/1.host_del_and_qc/cleandata/${i}.bowtie.sam \ --v...

文章 从技术雷达看​DevOps的十年——容器技术和微服务

...这一篇，我们将通过技术雷达上相关条目的变化来考察 Docker 和微服务的发展。   在 Docker 技术出现之前，可以说是 DevOps 技术的 1.0 的时代，人们关注如何做好 CI/CD 和基础设施即代码。而 Docker 的出现迎来了 DevOps 2.0 时代，De...

问题 你好，我也遇到了一样的问题：docker里omicsclass的镜像都搜索不到了，然后下载omicsclass/gene-family:v1.0.1也报错，联系客服也没有回应，可以请教一下你是怎么解决的吗

问题 动植物基因组注释问题中重复序列注释的问题

上次提到了提供的docker的images中没有找到repeatmasker的数据库RepeatMaskerLib.h5的问题。紧接着我发现流程中的famdb.py脚本也找不到，这个脚本我再课程提供的脚本文件夹中中没找到，同时我在docker的镜像中也没找到。是不是和RepeatMask...

文章 PDF翻译神器：PDFMathTranslate让看英文文献不再成为烦恼

...互界面，以及容器化部署 安装与使用  建议直接使用 docker 的方式安装，简单又方便，其他安装方法参考：https://github.com/Byaidu/PDFMathTranslate/blob/main/docs/README_zh-CN.md 在终端执行下面命令（需要体腔安装并启动 docker，如果不会请...

文章 quota 显示的space 与du显示的不一致，导致文件上传失败

这是因为你在docker容器里面删除数据，容器一直挂在后台导致quota没有及时更新 应该及时清除容器，这样quota才刷新存储限额： docker rm -f $(docker ps -qa)  #删除所有容器 参考：https://unix.stackexchange.com/questions/156897/why-does-du-...

问题 请问用相同的文件，只是把名字改了一下，然后docker自动把重复的序列删除后，为什么出来的motif不一样啊，然后我又把名字改成不一样的，让他不能过滤掉重复序列，之后生成的就和之前的一样了，是什么回事