在装docker的过程中如有以下报错 解决方法:新建containers.cmd,编辑内容如下,以管理员身份运行,执行完后按照提示重启电脑 pushd "%~dp0"dir /b %SystemRoot%\servicing\Packages\*containers*.mum >containers.txtfor /f %%i in ('findstr /i . con...
输入的命令是for i in `tail -n+2 $datafile/metadata.txt|cut -f1`;do bowtie2 --threads 6 \ -x $host_index/Canis_lupus/wolf \ -1 $workdir/1.host_del_and_qc/cleandata/${i}_1.fastq \ -2 $workdir/1.host_del_and_qc/cleandata/${i}_2.fastq \ -S $workdir/1.host_del_and_qc/cleandata/${i}.bowtie.sam \ --v...
...这一篇,我们将通过技术雷达上相关条目的变化来考察 Docker 和微服务的发展。 在 Docker 技术出现之前,可以说是 DevOps 技术的 1.0 的时代,人们关注如何做好 CI/CD 和基础设施即代码。而 Docker 的出现迎来了 DevOps 2.0 时代,De...
上次提到了提供的docker的images中没有找到repeatmasker的数据库RepeatMaskerLib.h5的问题。紧接着我发现流程中的famdb.py脚本也找不到,这个脚本我再课程提供的脚本文件夹中中没找到,同时我在docker的镜像中也没找到。是不是和RepeatMask...
...互界面,以及容器化部署 安装与使用 建议直接使用 docker 的方式安装,简单又方便,其他安装方法参考:https://github.com/Byaidu/PDFMathTranslate/blob/main/docs/README_zh-CN.md 在终端执行下面命令(需要体腔安装并启动 docker,如果不会请...
这是因为你在docker容器里面删除数据,容器一直挂在后台导致quota没有及时更新 应该及时清除容器,这样quota才刷新存储限额: docker rm -f $(docker ps -qa) #删除所有容器 参考:https://unix.stackexchange.com/questions/156897/why-does-du-...
...析的绝对分析标准。 我们组学大讲堂提供的扩增子分析docker镜像(v1.4)使用的qiime2 版本为:Qiime2.2020.8版本。目前qiime2的最新版本为2022.8,相较于2020.8版本有很多大的更新,更新信息如下: 扩增子docker镜像更新说明 为使大家...
...kdir mysql cd mysql mkdir log data conf #下载mysql 官方镜像 #docker pull mysql:5.7 #启动镜像 docker run -p 3399:3306 --name mysql_pasa \ -v $PWD/log:/var/log/mysql \ -v $PWD/data:/var/lib/mysql \ -v $PWD/conf:/etc/mysql \ -e MYSQL_ROOT_PASSWORD=123456 \ -d mysql:5.7 老师...
...入“. doc.sh”,出现报错信息“? Please select an image: ▸ docker.io/omicsclass/metagenomics:v1.0 quay.io/omicsclass/metagenomics:v1.0” 我在doc.sh文件代码中输入第一个镜像,可以启动docker pull进行镜像下载,但是4个小时后仍然报错“Error: writ...
...入“. doc.sh”,出现报错信息“? Please select an image: ▸ docker.io/omicsclass/metagenomics:v1.0 quay.io/omicsclass/metagenomics:v1.0” 我在doc.sh文件代码中输入第一个镜像,可以启动docker pull进行镜像下载,但是4个小时后仍然报错“Error: ...