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文章 win10装docker desktop提示Installation failed: Containers Windows Feature is not available

在装docker的过程中如有以下报错 解决方法:新建containers.cmd,编辑内容如下,以管理员身份运行,执行完后按照提示重启电脑 pushd "%~dp0"dir /b %SystemRoot%\servicing\Packages\*containers*.mum >containers.txtfor /f %%i in ('findstr /i . con...

问题 docker中用cleandata与宿主序列比对得到sam文件这一步出现错误,

输入的命令是for i in `tail -n+2 $datafile/metadata.txt|cut -f1`;do bowtie2 --threads 6 \ -x $host_index/Canis_lupus/wolf \ -1 $workdir/1.host_del_and_qc/cleandata/${i}_1.fastq \ -2 $workdir/1.host_del_and_qc/cleandata/${i}_2.fastq \ -S $workdir/1.host_del_and_qc/cleandata/${i}.bowtie.sam \ --v...

文章 从技术雷达看​DevOps的十年——容器技术和微服务

...这一篇,我们将通过技术雷达上相关条目的变化来考察 Docker 和微服务的发展。   在 Docker 技术出现之前,可以说是 DevOps 技术的 1.0 的时代,人们关注如何做好 CI/CD 和基础设施即代码。而 Docker 的出现迎来了 DevOps 2.0 时代,De...

问题 你好,我也遇到了一样的问题:docker里omicsclass的镜像都搜索不到了,然后下载omicsclass/gene-family:v1.0.1也报错,联系客服也没有回应,可以请教一下你是怎么解决的吗

问题 动植物基因组注释问题中重复序列注释的问题

上次提到了提供的docker的images中没有找到repeatmasker的数据库RepeatMaskerLib.h5的问题。紧接着我发现流程中的famdb.py脚本也找不到,这个脚本我再课程提供的脚本文件夹中中没找到,同时我在docker的镜像中也没找到。是不是和RepeatMask...

文章 PDF翻译神器:PDFMathTranslate让看英文文献不再成为烦恼

...互界面,以及容器化部署 安装与使用  建议直接使用 docker 的方式安装,简单又方便,其他安装方法参考:https://github.com/Byaidu/PDFMathTranslate/blob/main/docs/README_zh-CN.md 在终端执行下面命令(需要体腔安装并启动 docker,如果不会请...

文章 quota 显示的space 与du显示的不一致,导致文件上传失败

这是因为你在docker容器里面删除数据,容器一直挂在后台导致quota没有及时更新 应该及时清除容器,这样quota才刷新存储限额: docker rm -f $(docker ps -qa)  #删除所有容器 参考:https://unix.stackexchange.com/questions/156897/why-does-du-...

问题 请问用相同的文件,只是把名字改了一下,然后docker自动把重复的序列删除后,为什么出来的motif不一样啊,然后我又把名字改成不一样的,让他不能过滤掉重复序列,之后生成的就和之前的一样了,是什么回事

问题 我想问下 生信引物设计的课 里面用docker上面的ssr引物设计程序设计出来的引物 是经过E-pcr筛选的吗 我看课里老师介绍了pl文件介绍里面有E-pcr程序 但具体有没有运行呢

问题 老师,我的电脑是win10家庭版,然后按您给的方法安装docker的时候需要先设置一下Hyper-V,但是我在以管理员身份运行Hyper-v.cmd时,运行过程一直卡在这一步,没有显示百分比,试过好几次了,一直是这样。

文章 组学大讲堂QIIME2(v1.5)镜像更新说明

...析的绝对分析标准。 我们组学大讲堂提供的扩增子分析docker镜像(v1.4)使用的qiime2 版本为:Qiime2.2020.8版本。目前qiime2的最新版本为2022.8,相较于2020.8版本有很多大的更新,更新信息如下: 扩增子docker镜像更新说明 为使大家...

问题 你好,我安装gwas的镜像报错failed to register layer: ApplyLayer exit status 1 stdout: stderr: lchown /biosoft/emmax-beta-07Mar2010: invalid argument。docker是最新版本10.14,安装其他镜像如转录组的和重测序的都没有问题 。

问题 mysql镜像启动问题

...kdir mysql cd mysql mkdir log data conf  #下载mysql 官方镜像  #docker pull mysql:5.7 #启动镜像 docker run -p 3399:3306 --name mysql_pasa \ -v $PWD/log:/var/log/mysql \ -v $PWD/data:/var/lib/mysql \ -v $PWD/conf:/etc/mysql \ -e MYSQL_ROOT_PASSWORD=123456 \ -d mysql:5.7 老师...

问题 《微生物宏基因组分析实操》课程,配制分析环境(doc.sh)遇到Bug

...入“. doc.sh”,出现报错信息“? Please select an image:   ▸ docker.io/omicsclass/metagenomics:v1.0    quay.io/omicsclass/metagenomics:v1.0” 我在doc.sh文件代码中输入第一个镜像,可以启动docker pull进行镜像下载,但是4个小时后仍然报错“Error: writ...

问题 《微生物宏基因组分析实操》课程,配制分析环境(doc.sh)遇到Bug

...入“. doc.sh”,出现报错信息“? Please select an image:   ▸ docker.io/omicsclass/metagenomics:v1.0    quay.io/omicsclass/metagenomics:v1.0” 我在doc.sh文件代码中输入第一个镜像,可以启动docker pull进行镜像下载,但是4个小时后仍然报错“Error: ...