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问题 老师,我做gwas分析过程中出现这种问题,该如何解决呢?

问题 老师,我做gwas分析过程中出现这种问题,该如何解决呢?

文章 在运行R时报错缺失libpcre2-8.so.0这个共享库文件

...libpcre2-8.so.0是PCRE(Perl Compatible Regular Expressions)库的一个版本,通常用于支持正则表达式。 解决方法: 1.安装或更新PCRE库。根据你使用的Linux发行版,可以使用相应的包管理器安装或更新PCRE库。例如,在基于Debian的系统中,...

问题 进行16S分析时,对样品按照分组进行分类汇总出现问题。

已解决

问题 使用FUSION进行TWAS分析权重训练问题

再使用自己的数据进行权重训练的时候,当使用加入blup模型运行GEUV.compute_weights.sh脚本时报错,去除该模型可以正常运行时怎么回事?需要如何解决?

话题 基因结构分析及在染色体位置上的信息提取

问题 使用monocle3进行轨迹分析报错

使用单细胞转录组学课程中的代码使用monocle3进行轨迹分析报错。 这是我的代码: Rscript $scripts/cell_trajectory_monocle3.r --rds ../05.Find_Markers/CD4.added.celltype.rds \--use.seurat.umap --groupby mycelltype -o monocle3.1 --cpu 4 这是CD4.added.celltype.rds所对...

问题 老师好 请问基于Fst和Pi的选择清除 如何看哪些受选择区域是属于哪个群体的呢

请问老师 比如这个图 是是看Pi的比较顺序 左边的受选择区域是分子上(ZQ)的群体的,右边的受选择区域是分母上(ZD)的 群体的?知道是否可以这么说。我看好多文章都有这个规律。我的是公司给的图,技术人员说这个...

问题 R 语言批量做相关性分析correlation

有很多基因,测了转录组和蛋白质组,需要看看基因之间的相关性,基因太多能批量求每个基因的相关性吗?

问题 进化分析时如何再分为几个亚家族

老师,我想得到如下图片:我做的进化树是这种圆形的,是需要其它的软件吗;另外根据什么再进一步分成亚家族啊? 

问题 请问老师有基础教学肿瘤二代测序生信分析课程吗?

新手想学习

问题 R 语言做lncRNA-mRNA皮尔森相关性分析correlation

两组共6个样本,上千个差异lncRNA 、mRNA,表中数据是RPKM值,如何用R语言做lncRNA-mRNA皮尔森相关性分析?cor函数输入文件是什么格式?

问题 老师,我在做共线行分析时,出现这种情况,该如何解决

明明里面有这个文件

问题 求助,扩增子测在OTU分析时,这一步报错~

求助大佬,在扩增子测序时,使用assign taxonomy.py报错

文章 如何从GWAS结果中获取表型解释率PVE——TASSEL、GEMMA篇

...看到。 二、如何从GWAS结果中获取解释率PVE gwas关联分析可以使用很多软件,也可以计算各种模型。接下来主要说明TASSEL和GEMMA怎么得到解释率 1.TASSEL TASSEL是可以直接得到pve值的,直接使用数据即可 1.1 GLM模型 marker_Rsq ...