问题 老师这条代码里面INV[0-9]、DUP[0-9]， 0-9是什么意思，输出文件中INV后面跟着的数字代表什么

... An1 C24 Cvi Eri Kyo Ler Sha;do    # 提取INS插入和DEL 的SV 大于 50bp   awk '$1 ~ /#/ || ($3 ~ /^INS/ || $3 ~ /^DEL/) && (length($5)-length($4)>50 || length($4)-length($5)>50)' $query.syri.vcf | sed  "/^#CHROM/s/sample/${query}/" > $query.INS_DEL.vcf   # 提取SR : IN...

问题 泛基因家族分析-SV和表达量

老师您好。我的泛基因组为15个品系基因组构成，参考基因组为JG。为啥我WRKY_gene_fpkm.filter.xls的结果缺少SD和RA品系的呢？

问题 各位老师好，请问无参转录组（没参考基因组）做基因家族分析能发SCI么？

...考基因组，但是近缘物种有。自己做了种子的无参转录组分析，发现了一个属于基因家族的hub gene，想做做基因家族分析，然后加点下游实验发篇小SCI，影响因子、分区无要求，是SCI就行。请问能发么？需要加哪些实验呢？还有...

文章 超长染色体的转录组分析注意要点

不同物种进行转录组分析的时候流程大致相同，但是当我们做的物种有一个庞大的基因组，那么流程中有一些参数需要进行修改： 1. Markdup和SplitNTrim的时候不要生成bai的索引，主要是 Markdup的时候不要使用参数“-CREATE_INDEX true”...

问题 基因家族分析：基因与mRNA的对应关系，出现如下错误

运行命令时出现如下错误： GFF文件：

问题 群体遗传分析过程中无法构建进化树

过程中supergene.phy和fasttree.nwk都可以生成，但利用ggtree.r -t fasttree.nwk -f $GROUP -g Group -n fasttree构建进化树就开始报错，邱老师解答：

问题 进化树+motif+基因结构采用之前课程中介绍的TBtools把三者合成一个图的时候，基因名字重叠（分析用的序列数154条），看不清，图中字体大小无法批量修改！PS:输入少量序列进行分析，物种基因名字不会重叠，能看清这种情况怎么处理呢？

问题 老师，您好，按照视频学习完基因家族分析这部分之后，您给的脚本上还包括一些结合转录组分析家族成员表达量的内容，请问一下，我没有测序，但是我想继续把这部分做完，有没有接着这部分的学习视频，谢谢。

问题 老师您好，我这边在处理扩增子数据分析时，进行OTU分析时不论用哪种方法都会报错“ERROR RAISED DURING STEP:Assign taxonomy” segmentation fault，用您那边提供的样本数据也是有这个报错，请问怎么解决呀！

问题 我现在有公共数据库其中500＋种子，自己测了这种品种的一些表型，要做GWAS分析的话，请问老师，是通过下载fastq文件，自己组装拼接，然后比对到参考基因组上，然后获得这500个品种的VCF文件，然后进行GWAS分析吗？

问题 想请问安捷伦双通道芯片数据得到了cy5和cy3通道的数据，想要做一些其它的分析，请问可以单独提取cy5的数据吗？然后对cy5中的数据重新进行别的分析？比如细胞类型反卷积之类的

问题 转录组分析GO富集和GO分类有何区别？

问题 想要分析有参转录组，除了测序数据，还需要什么文件？

问题 请问转录组分析中的物种分布是怎么统计出来的？

问题 做完GWAS分析有必要做转录组测序进行关联验证么？