问题 有公开发表的基因家族分析文章做了家族成员是否存在假基因的鉴定，请问具体怎么鉴定？

问题 请问做基因组内共线性分析时，发现只有 一对 串联重复基因，这个图还有必要做吗？

问题 请问老师有Mcscan分析时用到的get_gene_position.pl文件吗

最好把Mcscan课程的资料发我邮箱1452897634@qq.com, 课程链接失效了

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问题 请问jcvi分析生成simple文件时--minspan=30指的是什么？

python -m jcvi.compara.synteny screen --minspan=30 --simple aly.ath.anchors aly.ath.anchors.new 请问这一步中--minspan=30 指的是什么的最小跨度为30？是共线性区段的最小长度是30kb还是基因数量最小是30，还是指其他的什么

问题 用无参转录组做基因家族分析

老师您好。我现在用一个无参的转录组筛选某基因家族，我看到您之前说只要有蛋白文件就可以用有参的方法来筛选。我有两个问题：1.无参转录组中有unigene的pfam注释文件，能不能直接搜索我要找的基因家族来确定？是否还需...

问题 基因家族分析时搜索到两个没有组装到染色体水平的基因，请问可以删除这两个基因吗

问题 共线性分析时，导出的文件WRKY.collinear.pairs出现这样怎么回事，运行过程中没有报错

问题 老师，我想请问一下16S数据分析的这套代码，必须安装docker镜像才能运行吗？

问题 基因家族结构分析，为什么会出现下图图形盖住基因名的情况，怎样可以改正呢

问题 老师 就是我在做比较基因分析的时候生成的bed文件是空的 这是什么问题呀

问题 老师 就是我在做比较基因分析的时候生成的bed文件是空的 这是什么问题呀

文章 单细胞分析 质控 线粒体 红细胞 核糖体

过高的线粒体含量可能是因为细胞质RNA穿过细胞膜导致，或者在取样的过程中死亡细胞过多正常：心肌等耗能较多的地方，线粒体基因含量也可能会比较高 人：^MT- 小鼠：^mt- 检测是否存在血红蛋白污染 人：^HB[^PES] 小鼠：^...

问题 老师请问一下，在用pheatmap做热图时，scale函数我有点不明白，这个函数可以对横行或者竖行标准化，即分别设置为row或者column，可是这样有个问题就是，如果我做横行标准化的话，就会出现横行某个基因的某个值明明比另一个基因的某个值大，但是颜色上确实值小的反而比值大的深，那这怎么办呢

问题 老师您好，我想请问一下，我在做GEO双通道芯片标准化时遇到下面这种情况，一直没有报错，而且看起来exprs=exprs.MA(MAList)这一步head了一下也是合适的，但是到averMAList=avereps(MAList,ID=MAList$genes$ID)这一段应该是出了问题，但没有报错，得到的normalized_expression_M.csv文件里面不太对