文章 cytoscape插件BinGO安装以及GO富集分析和网络可视化

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文章 GWAS与遗传进化中的一些名词解释

...在亚群之间可能不同，因此群体分层可能导致假阳性关联和/或掩盖真实关联。筷子基因就是一个很好的例子，由于群体分层的现象而导致得到 SNP 可以用来解释用筷子吃饭的习惯的结论[2]。 Single nucleotide polymorphism （SNP）单核苷...

文章 csvtk，A powerful software for handling CSV files

...值（CSV）文件的实用命令行程序。由于其简单性、灵活性和效率，对于经常处理CSV文件的人来说，特别是在数据科学、生物信息学以及任何需要数据分析的领域，CSVTK都是一种非常有价值的工具。 CSVTK的最大优点之一是其跨平台...

问题 您好 我使用GEO芯片数据课程的 download R文件下载 GSE80751和GPL17692时出现这个提示，运行后面的代码就会报错如图2，请问问题在哪里，怎么解决，谢谢！

问题 各位老师 您好 就是我知道啦组装基因组的gap还有端粒和着丝粒的位置和长度 我怎么将他们可视化在染色体上呀，就像下图一样。

问题 老师好！我在运用课程代码进行Treemix分析后，会生成：cov.gz,modelcov.gz,treeout.gz等相关文件，现在我想知道：在混合事件的情况下，覆盖方差的比例和估计的混合比例，这个应该怎么进行计算统计呀？谢谢大家！

问题 老师好！我在运用课程代码进行Treemix分析后，会生成：cov.gz,modelcov.gz,treeout.gz等相关文件，现在我想知道：在混合事件的情况下，覆盖方差的比例和估计的混合比例，这个应该怎么进行计算统计呀？谢谢大家！

文章 正选择分析之 Site Models

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文章 统计不同分组差异表达结果并统计上下调基因数目并绘制柱状图

...####### #批量读入相同后缀的文本文件，并且只截取第一列和最后一列files=list.files("./",pattern = "*DEG\\.final.txt",recursive = T)data=lapply(files,function(fl){d=read.table(fl,header=TRUE,comment.char="",sep = "\t",check.names=FALSE)[,c(1,18)]}) #将数据整理成表格myd...

文章 字节跳动核心竞争力到底是什么？

...、"招一群学习能力强，事业开阔，心智成熟的成年人，一起打天下"。从文字的角度上看，这个要求非常高，在企业发展初期很难落地，但在高速发展期非常适用。对应企业初期，更需要的是招募经过大学教育的年轻人，需要创...

问题 老师您好！我想请教您关于土壤微生物分子网络构建的问题。我的实验材料是某一林地四个季节的土壤样本，每季节三个重复，三个重复样本能用conet构建网络吗？如果不可以，可以用四个季节的样本（12个样本）放一起做网络吗？这样合理吗（要怎么解释这个网络）？谢谢！

文章 kaks和dnds是什么？

...，Ka/Ks表示的是两个蛋白编码基因的非同义替换率（Ka）和同义替换率（Ks）之间的比例。这个比例可以判断是否有选择压力作用于这个蛋白质编码基因。 让我们从最基本的道理开始讲起。如果你手头有两个不同物种的同一个...

文章 Unicycler二代、三代混合组装

...-2 clean_data/R2_paired.fq \-l clean_data/pacbio.fq -o unicyc 其中，-1 和 -2 指定二代测序的双端测序文件，-l （long）指定三代测序文件，-o 为输出目录，-t 指定线程数 组装过程包括以下六部分 1 二代矫错：spades read error correction2 二代组...

问题 进化树+motif+基因结构三个一起显示报错

老师好，这一步上课时老师没有演示，所以我在操作时一直出现错误。包括我用了demo里的数据也是报错。用的demo数据分别是：03文件夹.iqtree2.pep.fullLength；04文件夹meme.xml；05文件夹gene_exon_info.gff

文章 split_sample.r根据生存数据对样本随机分组

使用方法: usage: split_sample.r [-h] -i input [-e event] [-t time] [-p propotion] [-o outdir] [-n name] The complete data set is randomly divided into training set and test set optional arguments: -h, --help show this help message and exit -i input, --inpu...