平时大家使用docker按照我们组学大讲堂课程中老师的操作:一般是启动相应的镜像并进入docker,我们的镜像默认进入/work目录,然后通过-v选项把我们系统里面的数据文件目录映射到容器中,这样就可以在/work目录分析数据了。但...
....xls ${ref} 以上这个命令。 1.我WRKY_gene_fpkm.filter.xls的结果为啥是同一个ID会重复对应同一个品系基因组? 2.不需要的基因是指什么基因?能否通俗的解释一下呢。‘不需要的基因’这个是根据PAV_gene.list判断的吧
vcf文件储存的是样本的变异信息文件,在同一批次分析中,如果不是采用joint calling的方式进行分析,最终会获得单个样本的变异数据。这种文件很难对同组不同样本进行差异SNP分析,此处就需要对文件进行合并。vcf文件的合并...
.../ ,下载以下两个文件并把这两个文件放到database文件夹中并解压。 $ md5sum eggnog.db eggnog_proteins.dmnd #下载完成之后核对md5值065763df8f1593dc6d08c5ce06401fcf eggnog.db64fefa838833a6f3e220a06fb9d403cd eggnog_proteins.dmnd 2)利用docker工具搭建EggN...
...网上这方面的信息很少,甚至还有些生信大V做错误的高中低配笔记本推荐,点进去一看“中配”的性能反而远低于廉价的“低配”,相信他也和很多人一样认为贵的,性能就好。但事实并不是这样。 本文将介绍笔记本中的哪些...
这是我提取的基因信息 这是tiquxulie.pl脚本 运行的脚本
运行下面的代码时Abu=read.table('ES.txt',header=T) Abu<-as.matrix(Abu) table<-Abu table[table>0]<-1 table.generalist<-Abu[which(rowSums(table)>=1),] Abu<-table.generalist总是出现Error in V<-(*tmp*, value = *vtmp*) : invalid indexing这种报错,我想可能是...