问题 老师好，基因家族聚类结果怎么统计每个物种这两种情况的基因数量啊，multi_ortholog:该家族在所有物种均存在，且至少在1个物种中的成员数大于等于2个；other_ortholog:该家族在至少两个物种中存在，且至少在一个物种不存在；

问题 请问利用jcvi整理泛基因列表，做JCVI做共线性分析时，一直提示/bin/bash: lastdb: command not found，是没有安装Last软件包吗？目前使用的镜像是购买课程时老师提供的，数据是26个玉米基因组数据（由于空间不足，只用了19个基因组）

问题 关于细菌illumina测序数据demultiplex的问题

老师好，qiime cutadapt demux-paired把我原本有数万个的样品弄得只剩下了几千个。请问是哪出了问题？ 可以看到，除了71这个样品之外，我其他三个样品只有几百到两千个count了。而我的样品应该是有几万个到十几万个count的，就...

文章 全球诺贝尔获得奖人数排行榜，美国第一，中国垫底？

...次嘛？就是近几年的莫言和屠呦呦，这题太简单了，下一个！慢着，错了！正确答案，应该是——3个。还有1个是1957年的诺贝尔物理学奖，颁给了李政道与杨振宁，这两位大佬获奖时真真切切地是中华台北籍贯，只是后来李政道...

文章 腾讯、阿里、百度的项目管理能力为什么这么强?

腾讯做产品厉害，这个众人皆知。他们不仅打造了QQ和微信这样的国民产品，还形成了自己的产品方法和文化。 阿里最早的“中供铁军”名声远扬，他们的推广销售和业务拓展能力也形成了一种阿里文化。 百度一直以技术自居...

问题 为什么我出来的基因是67个，kaks图出来的却这么少呀？

问题 老师，我有20个不同菌株的基因序列（fasta文件），请问怎么进行基因组学分析？

问题 老师好！有个问题想请教一下: 之前选做的几个基因是根据旧版数据库里的CDs序列克隆的，现在数据库更新了，要求用新版数据库，但是新旧版数据库ID对不上，遇到这种怎么办呀？（基因数量比较好多，没办法一个一个blast来比对）

文章 GEO数据芯片数据挖掘-在线工具分析GDS数据

...据库主要接收基因表达数据。实验研究项目中一般包含多个样本基因表达数据，研究人员进行数据上传之后，网站管理人员会根据实验样本的处理，数据来源等对数据进行整理，将能够进行生物学比较和统计的样品数据归纳整理...

文章 geo_gene_exp_download.r GEO数据自动下载与整理

使用方法: $Rscript /share/work/huangls/piplines/omicsclass/tcga_geo/scripts/geo_gene_exp_download.r  -husage: /share/work/huangls/piplines/omicsclass/tcga_geo/scripts/geo_gene_exp_download.r       [-h] -g gse [-f func] [-p palette] [-G gpl] [-s Gene Symbol] [-x]       [--log2] [-o ou...

文章 immune_infiltrates_rnaseq.r RNA-seq 转录组数据免疫侵润分析

使用方法： $ Rscript immune_infiltrates_rnaseq.r -husage: immune_infiltrates_rnaseq.r       [-h] -i expset [-g gene.info] [-t type] [--tpm] [-o outdir]RNA seq 免疫侵润分析. In general values should be TPM-normalized ,not log-transformed.optional arguments:  -h, --help        ...

文章 immune_bar_plot.r 免疫侵润分析bar绘图

使用方法： $ Rscript  immune_bar_plot.r  -husage: immune_bar_plot.r [-h] -i filepath [-t title]                                                  [-a xlab] [-b ylab]                                                  [-m metadata]          ...

问题 WGCNA分析中，取材是，有5个植物发育时间点，两个品质高低不同的材料，三次生物学重复，也就是三十个样本，请问，针对其中某个材料某个时间点中的一次生物学重复不好的剔除后，影响WGCNA的分析吗？还有就是时间点可以作为一种表型作为输入文件吗？

文章 TCGA 数据的多组学WGCNA联合分析

...表达，从而构建两者之间的互作网络。 分析流程图 整个的分析流程如下图所示： 分析流程的步骤简述：     1. 从TCGA下载直肠癌的基因，miRNA表达数据     2. 分别针对基因，miRNA进行表达差异分析     3. 分别针对基因...

问题 老师好，我在做课时20 比较基因组学分析时 最后生成的图有9个染色体无法生成对比

老师好，我在做课时20 比较基因组学分析时 最后生成的图有9个染色体无法生成对比 但从这张图可以看出是有相关性的 请老师解答，谢谢~