问题 拟时分析筛选出的差异基因数量太少，有没有可以调整的参数去增加筛选数量

问题 老师，我在重新描述一下问题，mascanx方法和BLAST计算KAKS时筛选到的Segmental和Tandom加倍基因对，数目不一样，是不同算法的不同结果是吗？做CIRCOS时， 可以用BLAST计算KAKS时筛选到的Segmental和Tandom加倍基因对来做吗？我BLAST方法筛出来的串联重复等数目更多一些。

问题 wgcna得到模块后如何根据目的基因有关的tom值排序筛选候选基因呢

看到的教程里都是直接选模块中连接值top,想知道具体如何通过已知的目的基因得到比如tom值排序前30的候选基因。希望老师能贴一下代码

问题 老师，我正在做泛基因家族分析的系统发育树构建，构树过程中，出现以下的过程及警告，请老师帮忙看看是否正常，这些重新序列的编号是否有影响（序列对其修剪后有重复名称已去除），以及我下面的系统发育树这么多是否正常，还是需要筛掉一些？

...重新序列的编号是否有影响（序列对其修剪后有重复名称已去除），以及我下面的系统发育树这么多是否正常，还是需要筛掉一些？

问题 老师你好，我想问一下，我想用其他物种的一条蛋白质序列搜索小麦基因库有没有相似的基因，在Linux中怎么比对？谢谢

问题 老师，我在重新描述一下问题，mascanx方法和BLAST计算KAKS时筛选到的Segmental和Tandom加倍基因对，数目不一样，是不同算法的不同结果是吗？做CIRCOS圈图时， 可以用BLAST计算KAKS时筛选到的Segmental和Tandom加倍基因对来做吗？我BLAST方法筛出来的串联重复等数目更多一些。

问题 如何从已知的基因组里对特定通路上的基因进行筛选鉴定？

目前想研究果实上一条代谢通路上的两个关键基因，想鉴定一下这两个基因，找出这两个基因的所有成员有哪些再进行荧光定量观察其表达模式。果实有已知的基因组，但是怎么从基因组里鉴定这两个基因的成员不会操作？

文章 endnote 如何插入书籍引用

...的文章，而是一本书籍里面的一段，这时候我们谷歌学术搜索的时候很可能搜索到，google books。例如我要引用 这本书里面《Biosynthesis and perception of melon aroma》关于甜瓜香气的章节（281–305页）：谷歌学术搜索第一个是一本书， ...

问题 您好，我想问下如果我的基因家族有两个结构域，两个pfam号，我应该怎么筛选呢？？

问题 请问各位老师，E-value（e值）设定的根据是什么？对结构域筛选影响很大吗？

文章 NCBI下载SRR并转换为fastq文件

...色圆圈为步骤记录，蓝色为补充或其他选择： 一、NCBI搜索 进入NCBI官网，选择“BioProject”，搜索文献中提供的项目号 PRJNA356989 搜索结果如下： 点击BioSample对应的数字，跳转到以下界面： 任意点击一个样本，得到...

文章 如何快速从转录组数据中筛选目标基因！

如何从海量高通量测序数据中筛选出目标数据？这是困扰大多数老师的一个难题！ 以转录组为例，想要挖掘数据，首先要看得懂数据，这是基础。 接下来小编以一个excel的简单函数为例，演示一下如何从表格中快速筛选感兴趣...

文章 探索基因大数据的利器——SRA Explorer

...因组等重要信息。然而，随着数据量的增加，如何高效地搜索、浏览和获取所需的基因数据成为了许多研究者面临的挑战。幸运的是，现在有了一款强大而便捷的工具，帮助您轻松应对这一挑战——那就是SRA Explorer。 什么是SRA...

问题 请问筛选结构域之后进行的三大网站鉴定那，SMART能出结果，NCBI上筛不出来是怎么回事

问题 老师，想用ka/ks值画一个热图，而不是筛选大于1的基因做热图，请问如何修改代码及脚本？