输入文件应该格式没有问题
F2代人工群体的家系记录主要用来计算亲缘关系、群体结构和PCA,但是进行关联分析的时候还是仅用个体ID后面接性状就好了是嘛?表型性状是否需要符合正态分布?
本来已经按脚本步骤做完了圈图,然后到第十步分析KA/KS时要复制WRKY.tandem这个文件时发现这个文件是空的,还有一个文件也是空的,请问这是啥问题啊
请问如果是林木类F1或者F2代群体做GWAS时应该选择哪种模型,需要考虑群体结构吗?
拟南芥的ID号怎么转化成1/2/3/4的那种形式?
数据事先整理好这样之后我利用这个代码运行,但是有个代码没看懂,就是log_rank_p那步,图中标红框的那个2代表的含义,
cutoff为什么是2500?是从这个图里得出来的吗?视频里提到2500是中位生存时间,但是生存曲线是在ROC之后做的; 怎样处理表达矩阵中样品重复的问题?代码只对clinic进行了unique