对宏基因组数据进行αβ多样性分析时,进行抽平处理是不是会更好,然后进行微生物组成功能的差异分析时,需要做抽平处理后再求相对丰度吗

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1 个回答

xun - 电路元件工程师

beta多样性分析,常用的距离比如bray不需要抽平,如果要用欧式距离就抽吧
alpha多样性要抽平,
抽平数据和相对丰度没有本质区别,前者会损失数据,所以要看损失的多少决定用不用

功能分析用那个tpm 的,不抽平

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  • murakami 提出于 5天前

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