转录组数据分析时,进行到read 与基因组比对时,产生的sam文件为空,summary文件信息为: Error reading _rstarts[] array: 1010748, 1017096Error: Encountered internal HISAT2 exception (#1)Command: /biosoft/hisat2-2.1.0/hisat2-align-s --wrapper basic-0 -p 1...
回归分析中R2指的是结果变量(y)的观测值与y的拟合(即预测)值之间的相关系数;因此,R的值将始终为正,范围为0至1。 相关系数R2:表示你的曲线线性是否很好,理想状态是1,但是达不到。一般应该在0.99以上。越接近1,...
小白想用MeV软件进行K-Mean clustering分析。请问大家有没有详细的软件使用教程发我一份?(中文版图文最好)。目前有以下两个问题: 1.怎样准备数据文件?例如,需要分析不同时间点的样品中基因,将表达模式相同的基因聚类...
...定猪抗传染性胃肠炎病毒(TGEV)侵染功能基因及其调控作用分析 负责人:包文斌 申请单位:扬州大学 研究类型:面上项目 项目批准号:31972535 金额:58万 以上就是2019年度国自然基金中关于CRISPR技术相关的金额排名前5位的项...
您好.doc
老师好!想问下群体结构分析时,Rscript /work/my_pop_cucu/scripts/structure_plot.r -d ./ -s 137filtered.snp.pruned.nosex -f 137pop_group.txt -g Group,报错:WARNING: ignoring environment value of R_HOME --> Q&A for bioinformatics, please visit the website: https://www.om...
红色框中是两个基因并列在的一起,导致后续的分析没办法继续 这样的文件一共有600多个,所以希望老师能给我一个代码进行统一的整理,谢谢
这是什么原因啊 实在是找不到原因,希望老师帮忙解答
NCK_vs_NM_vs_TM.txt all_gene_fpkm.tsv all_gene_count.tsv
manager@bl8vbox[yu] /biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.graphics.karyotype --format=pdf --figsize=15x15 ph_seqid ph_layout06:27:19 [base] Load file `ph_layout`06:27:19 [base] Load file `PH.bed`06:27:20 [base] Load file `PY.bed`Traceback (most recent call last): File "/biosoft/minicond...
cellphoneDB是目前使用较为广泛的细胞通讯分析软件,包含配体、受体及其相互作用的数据库,可以对细胞间的通讯分子进行全面、系统的分析,以及研究不同细胞类型之间的相互交流及通讯网络。 数据库链接:https://www.cellphonedb...
这个是需要拼接吗
# -g为该物种繁殖一代的时间,比如人的默认为25年,该处值为-g 25 我做的是昆虫,一年可以繁殖3代,此时这个参数应如何设置呢?是0.3吗?
老师好,为什么WRKY_gene_fpkm.xls 和PAV_gene.list都存才Mba这个基因组,但是这个命令执行后,生成的WRKY_gene_fpkm.filter.xls中,其他基因组都有,就没有Mba基因组?
这是我的脚本 结果