问题 从发表文章中获取基因ID，从拟南芥网站下载的蛋白序列，用tbtools提取目的序列总说没有这些ID号

文章 linux命令之grep

linux中grep命令的用法 作为linux中最为常用的三大文本（awk，sed，grep）处理工具之一，掌握好其用法是很有必要的。首先谈一下grep命令的常用格式为：grep  [选项]  ”模式“  [文件]grep家族总共有三个：grep，egrep，fgrep。常用选...

问题 做BSA混池定位时，如果分离群体中隐性基因致死，没有纯合隐性植株，可以用测序的方法做BSA混池定位么？

问题 NBS基因家族分析过程中，怎么用paircoil2来确认CC结构域，提交数据后，结果怎么看是不是具有CC结构域？

问题 SRA数据下载

我用命令ascp -v -QT -l 400m -P33001 -k1 -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh --mode recv --host fasp.sra.ebi.ac.uk --user era-fasp --file-list fastq.txt ./ 下载SRA数据时总是断开，有什么办法可以让这个命令重复运行，能不能帮我写个shell 脚本 让这个...

文章 一个好的“产品经理”该如何诞生？

...点的操作。 亮点四：测试用例批量执行的功能肯定少不了，你需要的它都有哦。 亮点五：用例执行页面执行操作简单明了，还可以记录下了执行过程中发现的缺陷，执行人员的操作记录，一目了然 ![image.png](https://img-blog....

问题 老师，问一下，ncbi中没有基（因组注释文件（GFF），只有GENEBANK的文件（GBFF），这个文件可以转为GFF格式么，或者这个文件怎么用

问题 单倍型分析中最后一步失败，麻烦老师

Rscript $scriptsdir/hap_analysis.r -v site.recode.vcf -g $datadir/Chr6.gff3 -p $datadir/trait.txt -G $datadir/group.txt -c Chr6 -s 281569 -e 533955 WARNING: ignoring environment value of R_HOME --> Q&A for bioinformatics, please visit the website: https://www.omicsclass.com/ --> R begin...

问题 GEOquery 下载不了数据

> #args=commandArgs(TRUE) > ###通过阅读文献获得感兴趣的数据对应的登陆号，并准备下载 > GSE = "GSE66597" > ########################利用获得的GSE accession 和对应的GPL accession下载数据 ################### >  > workdir = "H:/gene_family/GEO...

问题 您好，我在安装rocks7.0计算节点的时候，识别kickstart失败，但是能有compute-0-1（）的步骤，然后重新开始后识别不了了，我改怎样删除记忆呀

问题 服务器putty上可以进行内存设定和线程设定吗？我按照基因家族环境分析环境搭建ppt上，对内存和线程进行设定，但是在putty上运行不了。

文章 Logistic回归模型介绍及使用（附脚本）

回归模型是统计中最常用的模型之一，它主要用于解释和预测。本文要讲解一种应用非常广泛的回归模型：Logistic回归（逻辑回归）。 Logistic回归方法主要是针对二分类问题的分析，即被预测的变量为二元变量，如成功或失败、...

文章 空间转录组动力学分析

... fromplotsimport plotPhiHeatmap, plotFiForAd fromutilsimport computFullGridVelocity, getGridPhi, getGridVelocityForSourceSink, getFiOfEmb, loadAddLayersVelocytoData In [19]:X_grid_full, V_grid_full, X_emb = computFullGridVelocity(ST, emb='spatial') gridPhi = getGridPhi(X_grid_full, V_grid_full, R...

文章 送你一个小巧好用的序列分析软件-APE-功能强大，操作简单！

...质翻译 选中序列后，点击CDS工具中Traslate或直接快捷键Ctrl+T，便可将选中序列翻译为蛋白质序列。以上是APE软件几个简单实用的功能，其实该软件还有很多其他功能，感兴趣的下载体验一下吧！ 上图就是APE网站首页，点击下载...

文章 dQTL.seq方法研究基因定位

...1、dQTG.seq2、smoothLOD、C'、Δsnp index、ED六种计算方法。 其中dQTG-seq1方法利用F2群体极端池标记等位基因数目来预测其基因型数目，通过观测的标记等位基因数目和预测的标记基因型数目构建了新统计量Gw，能显著提高基因检测功...